Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUT9

DENND5B, DENN domain-containing protein 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND5BQ6ZUT9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DENND5BQ6ZUT9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DENND5BQ6ZUT9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DENND5BQ6ZUT9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DENND5BQ6ZUT9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DENND5BQ6ZUT9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DENND5BQ6ZUT9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DENND5BQ6ZUT9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DENND5BQ6ZUT9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DENND5BQ6ZUT9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DENND5BQ6ZUT9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DENND5BQ6ZUT9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DENND5BQ6ZUT9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DENND5BQ6ZUT9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DENND5BQ6ZUT9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DENND5BQ6ZUT9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DENND5BQ6ZUT9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DENND5BQ6ZUT9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DENND5BQ6ZUT9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DENND5BQ6ZUT9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DENND5BQ6ZUT9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DENND5BQ6ZUT9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DENND5BQ6ZUT9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DENND5BQ6ZUT9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DENND5BQ6ZUT9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DENND5BQ6ZUT9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DENND5BQ6ZUT9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DENND5BQ6ZUT9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DENND5BQ6ZUT9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DENND5BQ6ZUT9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DENND5BQ6ZUT9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DENND5BQ6ZUT9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DENND5BQ6ZUT9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DENND5BQ6ZUT9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DENND5BQ6ZUT9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DENND5BQ6ZUT9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DENND5BQ6ZUT9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DENND5BQ6ZUT9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DENND5BQ6ZUT9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DENND5BQ6ZUT9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DENND5BQ6ZUT9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DENND5BQ6ZUT9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DENND5BQ6ZUT9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DENND5BQ6ZUT9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DENND5BQ6ZUT9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DENND5BQ6ZUT9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DENND5BQ6ZUT9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DENND5BQ6ZUT9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DENND5BQ6ZUT9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DENND5BQ6ZUT9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DENND5BQ6ZUT9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DENND5BQ6ZUT9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DENND5BQ6ZUT9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
DENND5BQ6ZUT9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DENND5BQ6ZUT9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DENND5BQ6ZUT9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DENND5BQ6ZUT9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DENND5BQ6ZUT9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DENND5BQ6ZUT9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DENND5BQ6ZUT9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DENND5BQ6ZUT9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DENND5BQ6ZUT9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DENND5BQ6ZUT9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DENND5BQ6ZUT9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28■■■□□ 2.07
DENND5BQ6ZUT9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DENND5BQ6ZUT9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DENND5BQ6ZUT9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DENND5BQ6ZUT9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DENND5BQ6ZUT9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DENND5BQ6ZUT9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DENND5BQ6ZUT9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DENND5BQ6ZUT9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DENND5BQ6ZUT9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DENND5BQ6ZUT9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DENND5BQ6ZUT9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DENND5BQ6ZUT9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DENND5BQ6ZUT9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DENND5BQ6ZUT9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DENND5BQ6ZUT9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
DENND5BQ6ZUT9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DENND5BQ6ZUT9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DENND5BQ6ZUT9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
DENND5BQ6ZUT9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DENND5BQ6ZUT9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DENND5BQ6ZUT9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DENND5BQ6ZUT9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DENND5BQ6ZUT9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DENND5BQ6ZUT9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DENND5BQ6ZUT9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DENND5BQ6ZUT9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DENND5BQ6ZUT9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DENND5BQ6ZUT9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DENND5BQ6ZUT9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
DENND5BQ6ZUT9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DENND5BQ6ZUT9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DENND5BQ6ZUT9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DENND5BQ6ZUT9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DENND5BQ6ZUT9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DENND5BQ6ZUT9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DENND5BQ6ZUT9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms