Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSA7

LRRC55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC55Q6ZSA7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
LRRC55Q6ZSA7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LRRC55Q6ZSA7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LRRC55Q6ZSA7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
LRRC55Q6ZSA7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
LRRC55Q6ZSA7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
LRRC55Q6ZSA7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LRRC55Q6ZSA7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LRRC55Q6ZSA7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LRRC55Q6ZSA7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LRRC55Q6ZSA7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LRRC55Q6ZSA7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LRRC55Q6ZSA7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
LRRC55Q6ZSA7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LRRC55Q6ZSA7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LRRC55Q6ZSA7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LRRC55Q6ZSA7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRRC55Q6ZSA7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRRC55Q6ZSA7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRRC55Q6ZSA7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
LRRC55Q6ZSA7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LRRC55Q6ZSA7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LRRC55Q6ZSA7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRRC55Q6ZSA7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRRC55Q6ZSA7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRRC55Q6ZSA7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRRC55Q6ZSA7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRRC55Q6ZSA7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRRC55Q6ZSA7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRRC55Q6ZSA7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRC55Q6ZSA7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRC55Q6ZSA7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRC55Q6ZSA7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
LRRC55Q6ZSA7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
LRRC55Q6ZSA7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRRC55Q6ZSA7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRRC55Q6ZSA7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRC55Q6ZSA7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRC55Q6ZSA7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRC55Q6ZSA7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRC55Q6ZSA7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRC55Q6ZSA7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRC55Q6ZSA7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRC55Q6ZSA7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRC55Q6ZSA7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRC55Q6ZSA7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRC55Q6ZSA7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRC55Q6ZSA7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRC55Q6ZSA7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRC55Q6ZSA7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRRC55Q6ZSA7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRC55Q6ZSA7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRC55Q6ZSA7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRC55Q6ZSA7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRC55Q6ZSA7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRC55Q6ZSA7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRC55Q6ZSA7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRC55Q6ZSA7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRC55Q6ZSA7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRC55Q6ZSA7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRC55Q6ZSA7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRC55Q6ZSA7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRC55Q6ZSA7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRRC55Q6ZSA7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRRC55Q6ZSA7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRC55Q6ZSA7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRC55Q6ZSA7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LRRC55Q6ZSA7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LRRC55Q6ZSA7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
LRRC55Q6ZSA7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRC55Q6ZSA7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRC55Q6ZSA7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRC55Q6ZSA7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRRC55Q6ZSA7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRRC55Q6ZSA7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRRC55Q6ZSA7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LRRC55Q6ZSA7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LRRC55Q6ZSA7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LRRC55Q6ZSA7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LRRC55Q6ZSA7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LRRC55Q6ZSA7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
LRRC55Q6ZSA7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LRRC55Q6ZSA7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LRRC55Q6ZSA7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LRRC55Q6ZSA7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC55Q6ZSA7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC55Q6ZSA7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC55Q6ZSA7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRC55Q6ZSA7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRC55Q6ZSA7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRC55Q6ZSA7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRC55Q6ZSA7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRC55Q6ZSA7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRC55Q6ZSA7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRC55Q6ZSA7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRC55Q6ZSA7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRC55Q6ZSA7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRC55Q6ZSA7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRC55Q6ZSA7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRC55Q6ZSA7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms