Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC129Q6ZRS4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC129Q6ZRS4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC129Q6ZRS4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC129Q6ZRS4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC129Q6ZRS4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CCDC129Q6ZRS4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC129Q6ZRS4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCDC129Q6ZRS4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC129Q6ZRS4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
CCDC129Q6ZRS4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC129Q6ZRS4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC129Q6ZRS4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC129Q6ZRS4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CCDC129Q6ZRS4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC129Q6ZRS4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CCDC129Q6ZRS4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC129Q6ZRS4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC129Q6ZRS4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CCDC129Q6ZRS4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC129Q6ZRS4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC129Q6ZRS4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC129Q6ZRS4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC129Q6ZRS4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC129Q6ZRS4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC129Q6ZRS4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC129Q6ZRS4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CCDC129Q6ZRS4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC129Q6ZRS4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC129Q6ZRS4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC129Q6ZRS4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC129Q6ZRS4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
CCDC129Q6ZRS4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CCDC129Q6ZRS4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CCDC129Q6ZRS4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CCDC129Q6ZRS4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC32■■■□□ 2.71
CCDC129Q6ZRS4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CCDC129Q6ZRS4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC129Q6ZRS4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC129Q6ZRS4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CCDC129Q6ZRS4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CCDC129Q6ZRS4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CCDC129Q6ZRS4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CCDC129Q6ZRS4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
CCDC129Q6ZRS4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CCDC129Q6ZRS4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CCDC129Q6ZRS4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CCDC129Q6ZRS4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CCDC129Q6ZRS4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
CCDC129Q6ZRS4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
CCDC129Q6ZRS4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CCDC129Q6ZRS4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
CCDC129Q6ZRS4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CCDC129Q6ZRS4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CCDC129Q6ZRS4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
CCDC129Q6ZRS4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CCDC129Q6ZRS4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
CCDC129Q6ZRS4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CCDC129Q6ZRS4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CCDC129Q6ZRS4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CCDC129Q6ZRS4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CCDC129Q6ZRS4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CCDC129Q6ZRS4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CCDC129Q6ZRS4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CCDC129Q6ZRS4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CCDC129Q6ZRS4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
CCDC129Q6ZRS4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.86■■■□□ 2.69
CCDC129Q6ZRS4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CCDC129Q6ZRS4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.86■■■□□ 2.69
CCDC129Q6ZRS4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
CCDC129Q6ZRS4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
CCDC129Q6ZRS4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
CCDC129Q6ZRS4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
CCDC129Q6ZRS4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
CCDC129Q6ZRS4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
CCDC129Q6ZRS4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
CCDC129Q6ZRS4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CCDC129Q6ZRS4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CCDC129Q6ZRS4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CCDC129Q6ZRS4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
CCDC129Q6ZRS4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
CCDC129Q6ZRS4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
CCDC129Q6ZRS4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
CCDC129Q6ZRS4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
CCDC129Q6ZRS4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CCDC129Q6ZRS4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
CCDC129Q6ZRS4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CCDC129Q6ZRS4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CCDC129Q6ZRS4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CCDC129Q6ZRS4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CCDC129Q6ZRS4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CCDC129Q6ZRS4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CCDC129Q6ZRS4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CCDC129Q6ZRS4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CCDC129Q6ZRS4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CCDC129Q6ZRS4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.76■■■□□ 2.68
CCDC129Q6ZRS4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
CCDC129Q6ZRS4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CCDC129Q6ZRS4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CCDC129Q6ZRS4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms