Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPR3

RPTN, Repetin, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPTNQ6XPR3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPTNQ6XPR3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPTNQ6XPR3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPTNQ6XPR3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPTNQ6XPR3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPTNQ6XPR3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPTNQ6XPR3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPTNQ6XPR3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPTNQ6XPR3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPTNQ6XPR3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPTNQ6XPR3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPTNQ6XPR3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPTNQ6XPR3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPTNQ6XPR3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPTNQ6XPR3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPTNQ6XPR3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RPTNQ6XPR3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPTNQ6XPR3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPTNQ6XPR3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPTNQ6XPR3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPTNQ6XPR3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPTNQ6XPR3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPTNQ6XPR3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPTNQ6XPR3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPTNQ6XPR3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPTNQ6XPR3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPTNQ6XPR3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPTNQ6XPR3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPTNQ6XPR3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPTNQ6XPR3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPTNQ6XPR3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPTNQ6XPR3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPTNQ6XPR3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPTNQ6XPR3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPTNQ6XPR3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPTNQ6XPR3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPTNQ6XPR3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPTNQ6XPR3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPTNQ6XPR3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPTNQ6XPR3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPTNQ6XPR3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPTNQ6XPR3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPTNQ6XPR3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPTNQ6XPR3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPTNQ6XPR3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RPTNQ6XPR3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPTNQ6XPR3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPTNQ6XPR3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPTNQ6XPR3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPTNQ6XPR3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPTNQ6XPR3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPTNQ6XPR3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPTNQ6XPR3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RPTNQ6XPR3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPTNQ6XPR3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPTNQ6XPR3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RPTNQ6XPR3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPTNQ6XPR3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPTNQ6XPR3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPTNQ6XPR3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPTNQ6XPR3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPTNQ6XPR3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPTNQ6XPR3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RPTNQ6XPR3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPTNQ6XPR3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPTNQ6XPR3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPTNQ6XPR3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPTNQ6XPR3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPTNQ6XPR3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPTNQ6XPR3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPTNQ6XPR3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPTNQ6XPR3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RPTNQ6XPR3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RPTNQ6XPR3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPTNQ6XPR3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPTNQ6XPR3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPTNQ6XPR3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPTNQ6XPR3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPTNQ6XPR3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPTNQ6XPR3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPTNQ6XPR3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPTNQ6XPR3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPTNQ6XPR3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPTNQ6XPR3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPTNQ6XPR3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPTNQ6XPR3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPTNQ6XPR3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPTNQ6XPR3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPTNQ6XPR3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPTNQ6XPR3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPTNQ6XPR3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPTNQ6XPR3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPTNQ6XPR3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPTNQ6XPR3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPTNQ6XPR3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPTNQ6XPR3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPTNQ6XPR3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPTNQ6XPR3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPTNQ6XPR3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPTNQ6XPR3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms