Protein–RNA interactions for Protein: Q6UUV7

CRTC3, CREB-regulated transcription coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRTC3Q6UUV7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRTC3Q6UUV7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CRTC3Q6UUV7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CRTC3Q6UUV7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CRTC3Q6UUV7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CRTC3Q6UUV7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CRTC3Q6UUV7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CRTC3Q6UUV7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CRTC3Q6UUV7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRTC3Q6UUV7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRTC3Q6UUV7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CRTC3Q6UUV7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CRTC3Q6UUV7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CRTC3Q6UUV7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CRTC3Q6UUV7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CRTC3Q6UUV7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CRTC3Q6UUV7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CRTC3Q6UUV7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CRTC3Q6UUV7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CRTC3Q6UUV7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CRTC3Q6UUV7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CRTC3Q6UUV7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CRTC3Q6UUV7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CRTC3Q6UUV7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CRTC3Q6UUV7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CRTC3Q6UUV7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CRTC3Q6UUV7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CRTC3Q6UUV7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CRTC3Q6UUV7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CRTC3Q6UUV7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CRTC3Q6UUV7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CRTC3Q6UUV7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CRTC3Q6UUV7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CRTC3Q6UUV7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CRTC3Q6UUV7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CRTC3Q6UUV7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CRTC3Q6UUV7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CRTC3Q6UUV7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CRTC3Q6UUV7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CRTC3Q6UUV7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CRTC3Q6UUV7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CRTC3Q6UUV7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CRTC3Q6UUV7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CRTC3Q6UUV7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CRTC3Q6UUV7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CRTC3Q6UUV7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CRTC3Q6UUV7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CRTC3Q6UUV7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CRTC3Q6UUV7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CRTC3Q6UUV7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CRTC3Q6UUV7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CRTC3Q6UUV7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CRTC3Q6UUV7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CRTC3Q6UUV7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CRTC3Q6UUV7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CRTC3Q6UUV7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CRTC3Q6UUV7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CRTC3Q6UUV7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CRTC3Q6UUV7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CRTC3Q6UUV7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CRTC3Q6UUV7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CRTC3Q6UUV7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CRTC3Q6UUV7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CRTC3Q6UUV7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CRTC3Q6UUV7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CRTC3Q6UUV7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRTC3Q6UUV7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRTC3Q6UUV7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRTC3Q6UUV7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CRTC3Q6UUV7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRTC3Q6UUV7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRTC3Q6UUV7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRTC3Q6UUV7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRTC3Q6UUV7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRTC3Q6UUV7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRTC3Q6UUV7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CRTC3Q6UUV7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CRTC3Q6UUV7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CRTC3Q6UUV7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CRTC3Q6UUV7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRTC3Q6UUV7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRTC3Q6UUV7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRTC3Q6UUV7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRTC3Q6UUV7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRTC3Q6UUV7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRTC3Q6UUV7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRTC3Q6UUV7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRTC3Q6UUV7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CRTC3Q6UUV7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRTC3Q6UUV7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRTC3Q6UUV7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRTC3Q6UUV7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRTC3Q6UUV7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRTC3Q6UUV7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRTC3Q6UUV7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRTC3Q6UUV7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRTC3Q6UUV7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRTC3Q6UUV7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRTC3Q6UUV7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRTC3Q6UUV7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms