Protein–RNA interactions for Protein: Q6RVD6

SPATA8, Spermatogenesis-associated protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA8Q6RVD6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPATA8Q6RVD6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPATA8Q6RVD6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPATA8Q6RVD6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPATA8Q6RVD6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPATA8Q6RVD6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPATA8Q6RVD6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPATA8Q6RVD6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPATA8Q6RVD6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPATA8Q6RVD6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPATA8Q6RVD6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SPATA8Q6RVD6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPATA8Q6RVD6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPATA8Q6RVD6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPATA8Q6RVD6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPATA8Q6RVD6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPATA8Q6RVD6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPATA8Q6RVD6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SPATA8Q6RVD6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SPATA8Q6RVD6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPATA8Q6RVD6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPATA8Q6RVD6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPATA8Q6RVD6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPATA8Q6RVD6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPATA8Q6RVD6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPATA8Q6RVD6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPATA8Q6RVD6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPATA8Q6RVD6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPATA8Q6RVD6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPATA8Q6RVD6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPATA8Q6RVD6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPATA8Q6RVD6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPATA8Q6RVD6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPATA8Q6RVD6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPATA8Q6RVD6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPATA8Q6RVD6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPATA8Q6RVD6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPATA8Q6RVD6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPATA8Q6RVD6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPATA8Q6RVD6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPATA8Q6RVD6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPATA8Q6RVD6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPATA8Q6RVD6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPATA8Q6RVD6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPATA8Q6RVD6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPATA8Q6RVD6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPATA8Q6RVD6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPATA8Q6RVD6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPATA8Q6RVD6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPATA8Q6RVD6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPATA8Q6RVD6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SPATA8Q6RVD6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SPATA8Q6RVD6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPATA8Q6RVD6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPATA8Q6RVD6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPATA8Q6RVD6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPATA8Q6RVD6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPATA8Q6RVD6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPATA8Q6RVD6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPATA8Q6RVD6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPATA8Q6RVD6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPATA8Q6RVD6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPATA8Q6RVD6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPATA8Q6RVD6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPATA8Q6RVD6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPATA8Q6RVD6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPATA8Q6RVD6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPATA8Q6RVD6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPATA8Q6RVD6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPATA8Q6RVD6 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPATA8Q6RVD6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPATA8Q6RVD6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SPATA8Q6RVD6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPATA8Q6RVD6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPATA8Q6RVD6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPATA8Q6RVD6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SPATA8Q6RVD6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPATA8Q6RVD6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPATA8Q6RVD6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SPATA8Q6RVD6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPATA8Q6RVD6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPATA8Q6RVD6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPATA8Q6RVD6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPATA8Q6RVD6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPATA8Q6RVD6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPATA8Q6RVD6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPATA8Q6RVD6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPATA8Q6RVD6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPATA8Q6RVD6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPATA8Q6RVD6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPATA8Q6RVD6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPATA8Q6RVD6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPATA8Q6RVD6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPATA8Q6RVD6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPATA8Q6RVD6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPATA8Q6RVD6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPATA8Q6RVD6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPATA8Q6RVD6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPATA8Q6RVD6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPATA8Q6RVD6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms