Protein–RNA interactions for Protein: Q6PI25

CNIH2, Protein cornichon homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH2Q6PI25 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNIH2Q6PI25 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNIH2Q6PI25 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNIH2Q6PI25 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNIH2Q6PI25 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNIH2Q6PI25 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNIH2Q6PI25 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNIH2Q6PI25 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNIH2Q6PI25 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNIH2Q6PI25 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNIH2Q6PI25 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNIH2Q6PI25 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNIH2Q6PI25 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNIH2Q6PI25 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNIH2Q6PI25 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNIH2Q6PI25 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNIH2Q6PI25 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNIH2Q6PI25 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNIH2Q6PI25 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNIH2Q6PI25 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNIH2Q6PI25 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNIH2Q6PI25 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNIH2Q6PI25 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNIH2Q6PI25 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNIH2Q6PI25 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNIH2Q6PI25 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNIH2Q6PI25 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNIH2Q6PI25 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNIH2Q6PI25 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNIH2Q6PI25 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNIH2Q6PI25 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNIH2Q6PI25 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNIH2Q6PI25 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNIH2Q6PI25 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNIH2Q6PI25 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNIH2Q6PI25 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNIH2Q6PI25 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNIH2Q6PI25 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CNIH2Q6PI25 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNIH2Q6PI25 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNIH2Q6PI25 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNIH2Q6PI25 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNIH2Q6PI25 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNIH2Q6PI25 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNIH2Q6PI25 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNIH2Q6PI25 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNIH2Q6PI25 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNIH2Q6PI25 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNIH2Q6PI25 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNIH2Q6PI25 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNIH2Q6PI25 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CNIH2Q6PI25 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNIH2Q6PI25 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNIH2Q6PI25 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNIH2Q6PI25 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNIH2Q6PI25 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNIH2Q6PI25 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNIH2Q6PI25 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNIH2Q6PI25 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNIH2Q6PI25 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNIH2Q6PI25 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNIH2Q6PI25 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNIH2Q6PI25 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNIH2Q6PI25 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNIH2Q6PI25 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNIH2Q6PI25 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNIH2Q6PI25 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNIH2Q6PI25 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNIH2Q6PI25 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNIH2Q6PI25 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNIH2Q6PI25 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNIH2Q6PI25 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNIH2Q6PI25 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNIH2Q6PI25 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNIH2Q6PI25 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNIH2Q6PI25 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNIH2Q6PI25 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNIH2Q6PI25 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNIH2Q6PI25 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNIH2Q6PI25 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNIH2Q6PI25 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CNIH2Q6PI25 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNIH2Q6PI25 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNIH2Q6PI25 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNIH2Q6PI25 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNIH2Q6PI25 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNIH2Q6PI25 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNIH2Q6PI25 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNIH2Q6PI25 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CNIH2Q6PI25 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNIH2Q6PI25 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNIH2Q6PI25 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNIH2Q6PI25 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CNIH2Q6PI25 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNIH2Q6PI25 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNIH2Q6PI25 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNIH2Q6PI25 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNIH2Q6PI25 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNIH2Q6PI25 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNIH2Q6PI25 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms