Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS38

ALKBH2, DNA oxidative demethylase ALKBH2, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH2Q6NS38 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALKBH2Q6NS38 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALKBH2Q6NS38 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALKBH2Q6NS38 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALKBH2Q6NS38 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALKBH2Q6NS38 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALKBH2Q6NS38 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALKBH2Q6NS38 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALKBH2Q6NS38 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALKBH2Q6NS38 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALKBH2Q6NS38 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALKBH2Q6NS38 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALKBH2Q6NS38 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ALKBH2Q6NS38 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALKBH2Q6NS38 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALKBH2Q6NS38 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ALKBH2Q6NS38 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALKBH2Q6NS38 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALKBH2Q6NS38 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALKBH2Q6NS38 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALKBH2Q6NS38 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALKBH2Q6NS38 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALKBH2Q6NS38 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALKBH2Q6NS38 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALKBH2Q6NS38 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALKBH2Q6NS38 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALKBH2Q6NS38 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALKBH2Q6NS38 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALKBH2Q6NS38 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALKBH2Q6NS38 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALKBH2Q6NS38 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALKBH2Q6NS38 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALKBH2Q6NS38 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALKBH2Q6NS38 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALKBH2Q6NS38 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALKBH2Q6NS38 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ALKBH2Q6NS38 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALKBH2Q6NS38 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALKBH2Q6NS38 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALKBH2Q6NS38 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALKBH2Q6NS38 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALKBH2Q6NS38 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALKBH2Q6NS38 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALKBH2Q6NS38 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALKBH2Q6NS38 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALKBH2Q6NS38 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALKBH2Q6NS38 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALKBH2Q6NS38 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ALKBH2Q6NS38 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALKBH2Q6NS38 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALKBH2Q6NS38 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALKBH2Q6NS38 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALKBH2Q6NS38 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALKBH2Q6NS38 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALKBH2Q6NS38 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALKBH2Q6NS38 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ALKBH2Q6NS38 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALKBH2Q6NS38 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALKBH2Q6NS38 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ALKBH2Q6NS38 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALKBH2Q6NS38 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALKBH2Q6NS38 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALKBH2Q6NS38 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALKBH2Q6NS38 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALKBH2Q6NS38 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALKBH2Q6NS38 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ALKBH2Q6NS38 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALKBH2Q6NS38 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALKBH2Q6NS38 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALKBH2Q6NS38 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ALKBH2Q6NS38 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ALKBH2Q6NS38 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALKBH2Q6NS38 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALKBH2Q6NS38 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALKBH2Q6NS38 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALKBH2Q6NS38 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALKBH2Q6NS38 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALKBH2Q6NS38 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALKBH2Q6NS38 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALKBH2Q6NS38 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALKBH2Q6NS38 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALKBH2Q6NS38 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ALKBH2Q6NS38 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALKBH2Q6NS38 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALKBH2Q6NS38 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALKBH2Q6NS38 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ALKBH2Q6NS38 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALKBH2Q6NS38 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALKBH2Q6NS38 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALKBH2Q6NS38 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALKBH2Q6NS38 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALKBH2Q6NS38 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALKBH2Q6NS38 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALKBH2Q6NS38 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALKBH2Q6NS38 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALKBH2Q6NS38 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALKBH2Q6NS38 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALKBH2Q6NS38 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALKBH2Q6NS38 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALKBH2Q6NS38 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms