Protein–RNA interactions for Protein: Q6B0B8

TIGD3, Tigger transposable element-derived protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIGD3Q6B0B8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TIGD3Q6B0B8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TIGD3Q6B0B8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TIGD3Q6B0B8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TIGD3Q6B0B8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TIGD3Q6B0B8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TIGD3Q6B0B8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TIGD3Q6B0B8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TIGD3Q6B0B8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TIGD3Q6B0B8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TIGD3Q6B0B8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TIGD3Q6B0B8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TIGD3Q6B0B8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TIGD3Q6B0B8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TIGD3Q6B0B8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TIGD3Q6B0B8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TIGD3Q6B0B8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TIGD3Q6B0B8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TIGD3Q6B0B8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TIGD3Q6B0B8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TIGD3Q6B0B8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TIGD3Q6B0B8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TIGD3Q6B0B8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TIGD3Q6B0B8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TIGD3Q6B0B8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TIGD3Q6B0B8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TIGD3Q6B0B8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TIGD3Q6B0B8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TIGD3Q6B0B8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TIGD3Q6B0B8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TIGD3Q6B0B8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TIGD3Q6B0B8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TIGD3Q6B0B8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TIGD3Q6B0B8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TIGD3Q6B0B8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TIGD3Q6B0B8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TIGD3Q6B0B8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TIGD3Q6B0B8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TIGD3Q6B0B8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TIGD3Q6B0B8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TIGD3Q6B0B8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TIGD3Q6B0B8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TIGD3Q6B0B8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TIGD3Q6B0B8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TIGD3Q6B0B8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TIGD3Q6B0B8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TIGD3Q6B0B8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TIGD3Q6B0B8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TIGD3Q6B0B8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TIGD3Q6B0B8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TIGD3Q6B0B8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TIGD3Q6B0B8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TIGD3Q6B0B8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TIGD3Q6B0B8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TIGD3Q6B0B8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TIGD3Q6B0B8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TIGD3Q6B0B8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TIGD3Q6B0B8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TIGD3Q6B0B8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TIGD3Q6B0B8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TIGD3Q6B0B8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TIGD3Q6B0B8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TIGD3Q6B0B8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TIGD3Q6B0B8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TIGD3Q6B0B8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TIGD3Q6B0B8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TIGD3Q6B0B8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TIGD3Q6B0B8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TIGD3Q6B0B8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TIGD3Q6B0B8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TIGD3Q6B0B8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TIGD3Q6B0B8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TIGD3Q6B0B8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TIGD3Q6B0B8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TIGD3Q6B0B8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TIGD3Q6B0B8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TIGD3Q6B0B8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TIGD3Q6B0B8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TIGD3Q6B0B8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TIGD3Q6B0B8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TIGD3Q6B0B8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TIGD3Q6B0B8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TIGD3Q6B0B8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TIGD3Q6B0B8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TIGD3Q6B0B8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TIGD3Q6B0B8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TIGD3Q6B0B8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TIGD3Q6B0B8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TIGD3Q6B0B8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TIGD3Q6B0B8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TIGD3Q6B0B8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TIGD3Q6B0B8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TIGD3Q6B0B8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TIGD3Q6B0B8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TIGD3Q6B0B8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TIGD3Q6B0B8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TIGD3Q6B0B8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TIGD3Q6B0B8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TIGD3Q6B0B8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TIGD3Q6B0B8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms