Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL7

FNDC7, Fibronectin type III domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC7Q5VTL7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FNDC7Q5VTL7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FNDC7Q5VTL7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FNDC7Q5VTL7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FNDC7Q5VTL7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FNDC7Q5VTL7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FNDC7Q5VTL7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
FNDC7Q5VTL7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
FNDC7Q5VTL7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FNDC7Q5VTL7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FNDC7Q5VTL7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FNDC7Q5VTL7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FNDC7Q5VTL7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FNDC7Q5VTL7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FNDC7Q5VTL7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FNDC7Q5VTL7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FNDC7Q5VTL7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FNDC7Q5VTL7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FNDC7Q5VTL7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FNDC7Q5VTL7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FNDC7Q5VTL7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FNDC7Q5VTL7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FNDC7Q5VTL7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FNDC7Q5VTL7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FNDC7Q5VTL7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FNDC7Q5VTL7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FNDC7Q5VTL7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FNDC7Q5VTL7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FNDC7Q5VTL7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FNDC7Q5VTL7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FNDC7Q5VTL7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FNDC7Q5VTL7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FNDC7Q5VTL7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FNDC7Q5VTL7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FNDC7Q5VTL7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FNDC7Q5VTL7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FNDC7Q5VTL7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FNDC7Q5VTL7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FNDC7Q5VTL7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FNDC7Q5VTL7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FNDC7Q5VTL7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FNDC7Q5VTL7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FNDC7Q5VTL7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FNDC7Q5VTL7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FNDC7Q5VTL7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FNDC7Q5VTL7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FNDC7Q5VTL7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
FNDC7Q5VTL7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
FNDC7Q5VTL7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FNDC7Q5VTL7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FNDC7Q5VTL7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FNDC7Q5VTL7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FNDC7Q5VTL7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FNDC7Q5VTL7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FNDC7Q5VTL7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FNDC7Q5VTL7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FNDC7Q5VTL7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FNDC7Q5VTL7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FNDC7Q5VTL7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FNDC7Q5VTL7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FNDC7Q5VTL7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FNDC7Q5VTL7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FNDC7Q5VTL7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FNDC7Q5VTL7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FNDC7Q5VTL7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FNDC7Q5VTL7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FNDC7Q5VTL7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FNDC7Q5VTL7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FNDC7Q5VTL7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FNDC7Q5VTL7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FNDC7Q5VTL7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FNDC7Q5VTL7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FNDC7Q5VTL7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FNDC7Q5VTL7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FNDC7Q5VTL7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FNDC7Q5VTL7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FNDC7Q5VTL7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FNDC7Q5VTL7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FNDC7Q5VTL7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FNDC7Q5VTL7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FNDC7Q5VTL7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FNDC7Q5VTL7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FNDC7Q5VTL7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FNDC7Q5VTL7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FNDC7Q5VTL7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FNDC7Q5VTL7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FNDC7Q5VTL7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FNDC7Q5VTL7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FNDC7Q5VTL7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FNDC7Q5VTL7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FNDC7Q5VTL7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FNDC7Q5VTL7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FNDC7Q5VTL7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FNDC7Q5VTL7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FNDC7Q5VTL7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FNDC7Q5VTL7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FNDC7Q5VTL7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FNDC7Q5VTL7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FNDC7Q5VTL7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FNDC7Q5VTL7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms