Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HERC4Q5GLZ8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
HERC4Q5GLZ8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HERC4Q5GLZ8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HERC4Q5GLZ8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
HERC4Q5GLZ8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HERC4Q5GLZ8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
HERC4Q5GLZ8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HERC4Q5GLZ8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
HERC4Q5GLZ8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HERC4Q5GLZ8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HERC4Q5GLZ8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HERC4Q5GLZ8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
HERC4Q5GLZ8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
HERC4Q5GLZ8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
HERC4Q5GLZ8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
HERC4Q5GLZ8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
HERC4Q5GLZ8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HERC4Q5GLZ8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HERC4Q5GLZ8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
HERC4Q5GLZ8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HERC4Q5GLZ8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
HERC4Q5GLZ8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
HERC4Q5GLZ8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
HERC4Q5GLZ8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
HERC4Q5GLZ8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HERC4Q5GLZ8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
HERC4Q5GLZ8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
HERC4Q5GLZ8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HERC4Q5GLZ8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HERC4Q5GLZ8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HERC4Q5GLZ8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HERC4Q5GLZ8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HERC4Q5GLZ8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HERC4Q5GLZ8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HERC4Q5GLZ8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HERC4Q5GLZ8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
HERC4Q5GLZ8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HERC4Q5GLZ8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HERC4Q5GLZ8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
HERC4Q5GLZ8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
HERC4Q5GLZ8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
HERC4Q5GLZ8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
HERC4Q5GLZ8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
HERC4Q5GLZ8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HERC4Q5GLZ8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HERC4Q5GLZ8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HERC4Q5GLZ8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
HERC4Q5GLZ8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HERC4Q5GLZ8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HERC4Q5GLZ8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HERC4Q5GLZ8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HERC4Q5GLZ8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
HERC4Q5GLZ8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HERC4Q5GLZ8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HERC4Q5GLZ8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
HERC4Q5GLZ8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
HERC4Q5GLZ8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HERC4Q5GLZ8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HERC4Q5GLZ8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HERC4Q5GLZ8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HERC4Q5GLZ8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HERC4Q5GLZ8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HERC4Q5GLZ8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HERC4Q5GLZ8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HERC4Q5GLZ8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HERC4Q5GLZ8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HERC4Q5GLZ8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HERC4Q5GLZ8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HERC4Q5GLZ8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HERC4Q5GLZ8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HERC4Q5GLZ8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HERC4Q5GLZ8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
HERC4Q5GLZ8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HERC4Q5GLZ8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HERC4Q5GLZ8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HERC4Q5GLZ8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
HERC4Q5GLZ8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HERC4Q5GLZ8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HERC4Q5GLZ8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HERC4Q5GLZ8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
HERC4Q5GLZ8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
HERC4Q5GLZ8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HERC4Q5GLZ8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HERC4Q5GLZ8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HERC4Q5GLZ8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HERC4Q5GLZ8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HERC4Q5GLZ8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HERC4Q5GLZ8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
HERC4Q5GLZ8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HERC4Q5GLZ8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HERC4Q5GLZ8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HERC4Q5GLZ8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HERC4Q5GLZ8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HERC4Q5GLZ8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HERC4Q5GLZ8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HERC4Q5GLZ8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HERC4Q5GLZ8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HERC4Q5GLZ8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HERC4Q5GLZ8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms