Protein–RNA interactions for Protein: Q56P42

PYDC2, Pyrin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYDC2Q56P42 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PYDC2Q56P42 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PYDC2Q56P42 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PYDC2Q56P42 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PYDC2Q56P42 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PYDC2Q56P42 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PYDC2Q56P42 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PYDC2Q56P42 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PYDC2Q56P42 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PYDC2Q56P42 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PYDC2Q56P42 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PYDC2Q56P42 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PYDC2Q56P42 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PYDC2Q56P42 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PYDC2Q56P42 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PYDC2Q56P42 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PYDC2Q56P42 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PYDC2Q56P42 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PYDC2Q56P42 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PYDC2Q56P42 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PYDC2Q56P42 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PYDC2Q56P42 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PYDC2Q56P42 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PYDC2Q56P42 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PYDC2Q56P42 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PYDC2Q56P42 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PYDC2Q56P42 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PYDC2Q56P42 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PYDC2Q56P42 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PYDC2Q56P42 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PYDC2Q56P42 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PYDC2Q56P42 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PYDC2Q56P42 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PYDC2Q56P42 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PYDC2Q56P42 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PYDC2Q56P42 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PYDC2Q56P42 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PYDC2Q56P42 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PYDC2Q56P42 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PYDC2Q56P42 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PYDC2Q56P42 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PYDC2Q56P42 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PYDC2Q56P42 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PYDC2Q56P42 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PYDC2Q56P42 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PYDC2Q56P42 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PYDC2Q56P42 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PYDC2Q56P42 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PYDC2Q56P42 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PYDC2Q56P42 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PYDC2Q56P42 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PYDC2Q56P42 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PYDC2Q56P42 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PYDC2Q56P42 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PYDC2Q56P42 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PYDC2Q56P42 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PYDC2Q56P42 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PYDC2Q56P42 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PYDC2Q56P42 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PYDC2Q56P42 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PYDC2Q56P42 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PYDC2Q56P42 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PYDC2Q56P42 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PYDC2Q56P42 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PYDC2Q56P42 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PYDC2Q56P42 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PYDC2Q56P42 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PYDC2Q56P42 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PYDC2Q56P42 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PYDC2Q56P42 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PYDC2Q56P42 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PYDC2Q56P42 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PYDC2Q56P42 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PYDC2Q56P42 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PYDC2Q56P42 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PYDC2Q56P42 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PYDC2Q56P42 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PYDC2Q56P42 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PYDC2Q56P42 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PYDC2Q56P42 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PYDC2Q56P42 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PYDC2Q56P42 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PYDC2Q56P42 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PYDC2Q56P42 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PYDC2Q56P42 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PYDC2Q56P42 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PYDC2Q56P42 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PYDC2Q56P42 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PYDC2Q56P42 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PYDC2Q56P42 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PYDC2Q56P42 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PYDC2Q56P42 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PYDC2Q56P42 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PYDC2Q56P42 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PYDC2Q56P42 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PYDC2Q56P42 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PYDC2Q56P42 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PYDC2Q56P42 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PYDC2Q56P42 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PYDC2Q56P42 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms