Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL12Q53G59 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL12Q53G59 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL12Q53G59 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL12Q53G59 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL12Q53G59 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL12Q53G59 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL12Q53G59 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL12Q53G59 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL12Q53G59 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL12Q53G59 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL12Q53G59 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL12Q53G59 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL12Q53G59 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL12Q53G59 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL12Q53G59 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL12Q53G59 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL12Q53G59 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL12Q53G59 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL12Q53G59 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL12Q53G59 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL12Q53G59 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL12Q53G59 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL12Q53G59 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL12Q53G59 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL12Q53G59 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL12Q53G59 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL12Q53G59 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL12Q53G59 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL12Q53G59 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL12Q53G59 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL12Q53G59 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL12Q53G59 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL12Q53G59 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL12Q53G59 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL12Q53G59 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL12Q53G59 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL12Q53G59 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL12Q53G59 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL12Q53G59 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL12Q53G59 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL12Q53G59 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
KLHL12Q53G59 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL12Q53G59 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL12Q53G59 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL12Q53G59 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL12Q53G59 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL12Q53G59 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL12Q53G59 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL12Q53G59 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL12Q53G59 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL12Q53G59 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL12Q53G59 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL12Q53G59 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL12Q53G59 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL12Q53G59 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL12Q53G59 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL12Q53G59 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL12Q53G59 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL12Q53G59 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL12Q53G59 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL12Q53G59 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL12Q53G59 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL12Q53G59 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL12Q53G59 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL12Q53G59 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL12Q53G59 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL12Q53G59 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL12Q53G59 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL12Q53G59 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL12Q53G59 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL12Q53G59 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL12Q53G59 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL12Q53G59 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL12Q53G59 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL12Q53G59 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL12Q53G59 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL12Q53G59 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL12Q53G59 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL12Q53G59 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL12Q53G59 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL12Q53G59 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL12Q53G59 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL12Q53G59 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL12Q53G59 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL12Q53G59 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL12Q53G59 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL12Q53G59 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL12Q53G59 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL12Q53G59 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL12Q53G59 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL12Q53G59 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL12Q53G59 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL12Q53G59 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL12Q53G59 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL12Q53G59 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KLHL12Q53G59 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL12Q53G59 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL12Q53G59 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL12Q53G59 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.4 ms