Protein–RNA interactions for Protein: Q53F19

NCBP3, Nuclear cap-binding protein subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP3Q53F19 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC35.09■■■■□ 3.21
NCBP3Q53F19 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
NCBP3Q53F19 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
NCBP3Q53F19 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
NCBP3Q53F19 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
NCBP3Q53F19 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
NCBP3Q53F19 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
NCBP3Q53F19 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
NCBP3Q53F19 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
NCBP3Q53F19 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
NCBP3Q53F19 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
NCBP3Q53F19 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
NCBP3Q53F19 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
NCBP3Q53F19 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
NCBP3Q53F19 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
NCBP3Q53F19 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC34.98■■■■□ 3.19
NCBP3Q53F19 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NCBP3Q53F19 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NCBP3Q53F19 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NCBP3Q53F19 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
NCBP3Q53F19 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
NCBP3Q53F19 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
NCBP3Q53F19 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
NCBP3Q53F19 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
NCBP3Q53F19 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
NCBP3Q53F19 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
NCBP3Q53F19 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
NCBP3Q53F19 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
NCBP3Q53F19 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
NCBP3Q53F19 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
NCBP3Q53F19 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
NCBP3Q53F19 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
NCBP3Q53F19 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
NCBP3Q53F19 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
NCBP3Q53F19 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
NCBP3Q53F19 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
NCBP3Q53F19 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
NCBP3Q53F19 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
NCBP3Q53F19 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
NCBP3Q53F19 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
NCBP3Q53F19 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
NCBP3Q53F19 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
NCBP3Q53F19 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
NCBP3Q53F19 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
NCBP3Q53F19 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
NCBP3Q53F19 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
NCBP3Q53F19 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
NCBP3Q53F19 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
NCBP3Q53F19 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
NCBP3Q53F19 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC34.78■■■■□ 3.16
NCBP3Q53F19 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
NCBP3Q53F19 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
NCBP3Q53F19 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
NCBP3Q53F19 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
NCBP3Q53F19 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
NCBP3Q53F19 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
NCBP3Q53F19 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
NCBP3Q53F19 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NCBP3Q53F19 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
NCBP3Q53F19 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
NCBP3Q53F19 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
NCBP3Q53F19 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
NCBP3Q53F19 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
NCBP3Q53F19 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
NCBP3Q53F19 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
NCBP3Q53F19 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC34.7■■■■□ 3.15
NCBP3Q53F19 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
NCBP3Q53F19 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
NCBP3Q53F19 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NCBP3Q53F19 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
NCBP3Q53F19 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
NCBP3Q53F19 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
NCBP3Q53F19 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
NCBP3Q53F19 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC34.67■■■■□ 3.14
NCBP3Q53F19 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NCBP3Q53F19 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NCBP3Q53F19 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
NCBP3Q53F19 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
NCBP3Q53F19 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
NCBP3Q53F19 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
NCBP3Q53F19 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
NCBP3Q53F19 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC34.64■■■■□ 3.14
NCBP3Q53F19 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
NCBP3Q53F19 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
NCBP3Q53F19 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
NCBP3Q53F19 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
NCBP3Q53F19 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
NCBP3Q53F19 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
NCBP3Q53F19 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
NCBP3Q53F19 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
NCBP3Q53F19 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
NCBP3Q53F19 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
NCBP3Q53F19 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
NCBP3Q53F19 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NCBP3Q53F19 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NCBP3Q53F19 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NCBP3Q53F19 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NCBP3Q53F19 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.13
NCBP3Q53F19 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
NCBP3Q53F19 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms