Protein–RNA interactions for Protein: Q504Q3

PAN2, PAN2-PAN3 deadenylation complex catalytic subunit PAN2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN2Q504Q3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PAN2Q504Q3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PAN2Q504Q3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PAN2Q504Q3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PAN2Q504Q3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PAN2Q504Q3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PAN2Q504Q3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PAN2Q504Q3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PAN2Q504Q3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PAN2Q504Q3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PAN2Q504Q3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PAN2Q504Q3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PAN2Q504Q3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PAN2Q504Q3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PAN2Q504Q3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PAN2Q504Q3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PAN2Q504Q3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PAN2Q504Q3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PAN2Q504Q3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PAN2Q504Q3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PAN2Q504Q3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PAN2Q504Q3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PAN2Q504Q3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PAN2Q504Q3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
PAN2Q504Q3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PAN2Q504Q3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PAN2Q504Q3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PAN2Q504Q3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PAN2Q504Q3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PAN2Q504Q3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PAN2Q504Q3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PAN2Q504Q3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PAN2Q504Q3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PAN2Q504Q3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PAN2Q504Q3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PAN2Q504Q3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PAN2Q504Q3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PAN2Q504Q3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PAN2Q504Q3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PAN2Q504Q3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PAN2Q504Q3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PAN2Q504Q3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PAN2Q504Q3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PAN2Q504Q3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PAN2Q504Q3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PAN2Q504Q3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PAN2Q504Q3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PAN2Q504Q3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PAN2Q504Q3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PAN2Q504Q3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PAN2Q504Q3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
PAN2Q504Q3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PAN2Q504Q3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PAN2Q504Q3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PAN2Q504Q3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PAN2Q504Q3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PAN2Q504Q3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PAN2Q504Q3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PAN2Q504Q3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PAN2Q504Q3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PAN2Q504Q3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PAN2Q504Q3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PAN2Q504Q3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PAN2Q504Q3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PAN2Q504Q3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PAN2Q504Q3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PAN2Q504Q3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PAN2Q504Q3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PAN2Q504Q3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PAN2Q504Q3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PAN2Q504Q3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PAN2Q504Q3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PAN2Q504Q3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PAN2Q504Q3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PAN2Q504Q3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PAN2Q504Q3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PAN2Q504Q3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PAN2Q504Q3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PAN2Q504Q3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PAN2Q504Q3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PAN2Q504Q3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PAN2Q504Q3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PAN2Q504Q3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PAN2Q504Q3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PAN2Q504Q3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PAN2Q504Q3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PAN2Q504Q3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PAN2Q504Q3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PAN2Q504Q3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PAN2Q504Q3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PAN2Q504Q3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PAN2Q504Q3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PAN2Q504Q3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PAN2Q504Q3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PAN2Q504Q3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PAN2Q504Q3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PAN2Q504Q3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PAN2Q504Q3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PAN2Q504Q3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PAN2Q504Q3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms