Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC38Q502W7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC38Q502W7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC38Q502W7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC38Q502W7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC38Q502W7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC38Q502W7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC38Q502W7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC38Q502W7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC38Q502W7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC38Q502W7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC38Q502W7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC38Q502W7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC38Q502W7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC38Q502W7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC38Q502W7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC38Q502W7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC38Q502W7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC38Q502W7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC38Q502W7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC38Q502W7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC38Q502W7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC38Q502W7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC38Q502W7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC38Q502W7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC38Q502W7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC38Q502W7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CCDC38Q502W7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC38Q502W7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC38Q502W7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC38Q502W7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC38Q502W7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC38Q502W7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC38Q502W7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC38Q502W7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC38Q502W7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC38Q502W7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC38Q502W7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC38Q502W7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC38Q502W7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC38Q502W7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC38Q502W7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC38Q502W7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC38Q502W7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC38Q502W7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC38Q502W7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC38Q502W7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC38Q502W7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC38Q502W7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC38Q502W7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC38Q502W7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC38Q502W7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC38Q502W7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC38Q502W7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC38Q502W7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC38Q502W7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC38Q502W7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC38Q502W7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC38Q502W7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC38Q502W7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC38Q502W7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC38Q502W7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC38Q502W7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC38Q502W7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC38Q502W7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC38Q502W7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC38Q502W7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC38Q502W7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC38Q502W7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC38Q502W7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC38Q502W7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC38Q502W7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC38Q502W7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC38Q502W7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC38Q502W7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC38Q502W7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC38Q502W7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC38Q502W7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC38Q502W7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC38Q502W7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC38Q502W7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC38Q502W7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC38Q502W7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC38Q502W7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC38Q502W7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC38Q502W7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC38Q502W7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC38Q502W7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC38Q502W7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC38Q502W7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CCDC38Q502W7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC38Q502W7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC38Q502W7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC38Q502W7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC38Q502W7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC38Q502W7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC38Q502W7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC38Q502W7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC38Q502W7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC38Q502W7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms