Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYTL3Q4VX76 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYTL3Q4VX76 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYTL3Q4VX76 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYTL3Q4VX76 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYTL3Q4VX76 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYTL3Q4VX76 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYTL3Q4VX76 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYTL3Q4VX76 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYTL3Q4VX76 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYTL3Q4VX76 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYTL3Q4VX76 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYTL3Q4VX76 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYTL3Q4VX76 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYTL3Q4VX76 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYTL3Q4VX76 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SYTL3Q4VX76 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SYTL3Q4VX76 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYTL3Q4VX76 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYTL3Q4VX76 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYTL3Q4VX76 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYTL3Q4VX76 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYTL3Q4VX76 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SYTL3Q4VX76 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYTL3Q4VX76 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SYTL3Q4VX76 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYTL3Q4VX76 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYTL3Q4VX76 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYTL3Q4VX76 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYTL3Q4VX76 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYTL3Q4VX76 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYTL3Q4VX76 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYTL3Q4VX76 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYTL3Q4VX76 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYTL3Q4VX76 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYTL3Q4VX76 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYTL3Q4VX76 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYTL3Q4VX76 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYTL3Q4VX76 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYTL3Q4VX76 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYTL3Q4VX76 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYTL3Q4VX76 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYTL3Q4VX76 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYTL3Q4VX76 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYTL3Q4VX76 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYTL3Q4VX76 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYTL3Q4VX76 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SYTL3Q4VX76 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYTL3Q4VX76 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYTL3Q4VX76 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYTL3Q4VX76 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYTL3Q4VX76 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYTL3Q4VX76 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYTL3Q4VX76 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYTL3Q4VX76 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYTL3Q4VX76 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYTL3Q4VX76 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SYTL3Q4VX76 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYTL3Q4VX76 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYTL3Q4VX76 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYTL3Q4VX76 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYTL3Q4VX76 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYTL3Q4VX76 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYTL3Q4VX76 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYTL3Q4VX76 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYTL3Q4VX76 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SYTL3Q4VX76 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
SYTL3Q4VX76 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYTL3Q4VX76 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYTL3Q4VX76 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYTL3Q4VX76 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYTL3Q4VX76 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYTL3Q4VX76 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYTL3Q4VX76 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SYTL3Q4VX76 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SYTL3Q4VX76 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYTL3Q4VX76 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYTL3Q4VX76 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SYTL3Q4VX76 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYTL3Q4VX76 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYTL3Q4VX76 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYTL3Q4VX76 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYTL3Q4VX76 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYTL3Q4VX76 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYTL3Q4VX76 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYTL3Q4VX76 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYTL3Q4VX76 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYTL3Q4VX76 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYTL3Q4VX76 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYTL3Q4VX76 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYTL3Q4VX76 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYTL3Q4VX76 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYTL3Q4VX76 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYTL3Q4VX76 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SYTL3Q4VX76 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYTL3Q4VX76 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYTL3Q4VX76 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SYTL3Q4VX76 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SYTL3Q4VX76 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYTL3Q4VX76 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms