Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX62

C6orf99, Putative uncharacterized protein C6orf99, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf99Q4VX62 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C6orf99Q4VX62 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C6orf99Q4VX62 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C6orf99Q4VX62 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C6orf99Q4VX62 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C6orf99Q4VX62 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C6orf99Q4VX62 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C6orf99Q4VX62 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C6orf99Q4VX62 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C6orf99Q4VX62 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C6orf99Q4VX62 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C6orf99Q4VX62 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C6orf99Q4VX62 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C6orf99Q4VX62 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C6orf99Q4VX62 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
C6orf99Q4VX62 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C6orf99Q4VX62 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C6orf99Q4VX62 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C6orf99Q4VX62 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C6orf99Q4VX62 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C6orf99Q4VX62 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C6orf99Q4VX62 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C6orf99Q4VX62 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C6orf99Q4VX62 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C6orf99Q4VX62 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C6orf99Q4VX62 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C6orf99Q4VX62 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C6orf99Q4VX62 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C6orf99Q4VX62 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C6orf99Q4VX62 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C6orf99Q4VX62 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C6orf99Q4VX62 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C6orf99Q4VX62 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C6orf99Q4VX62 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C6orf99Q4VX62 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C6orf99Q4VX62 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C6orf99Q4VX62 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C6orf99Q4VX62 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C6orf99Q4VX62 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C6orf99Q4VX62 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C6orf99Q4VX62 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C6orf99Q4VX62 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C6orf99Q4VX62 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C6orf99Q4VX62 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C6orf99Q4VX62 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C6orf99Q4VX62 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C6orf99Q4VX62 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C6orf99Q4VX62 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C6orf99Q4VX62 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C6orf99Q4VX62 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C6orf99Q4VX62 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C6orf99Q4VX62 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C6orf99Q4VX62 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C6orf99Q4VX62 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C6orf99Q4VX62 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C6orf99Q4VX62 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C6orf99Q4VX62 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C6orf99Q4VX62 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C6orf99Q4VX62 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C6orf99Q4VX62 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C6orf99Q4VX62 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C6orf99Q4VX62 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C6orf99Q4VX62 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C6orf99Q4VX62 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C6orf99Q4VX62 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C6orf99Q4VX62 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C6orf99Q4VX62 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C6orf99Q4VX62 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C6orf99Q4VX62 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C6orf99Q4VX62 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C6orf99Q4VX62 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C6orf99Q4VX62 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C6orf99Q4VX62 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C6orf99Q4VX62 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C6orf99Q4VX62 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C6orf99Q4VX62 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C6orf99Q4VX62 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
C6orf99Q4VX62 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C6orf99Q4VX62 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C6orf99Q4VX62 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C6orf99Q4VX62 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C6orf99Q4VX62 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C6orf99Q4VX62 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
C6orf99Q4VX62 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C6orf99Q4VX62 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C6orf99Q4VX62 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C6orf99Q4VX62 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C6orf99Q4VX62 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C6orf99Q4VX62 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C6orf99Q4VX62 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C6orf99Q4VX62 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C6orf99Q4VX62 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C6orf99Q4VX62 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C6orf99Q4VX62 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C6orf99Q4VX62 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C6orf99Q4VX62 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C6orf99Q4VX62 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C6orf99Q4VX62 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C6orf99Q4VX62 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C6orf99Q4VX62 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms