Protein–RNA interactions for Protein: Q4U2R8

SLC22A6, Solute carrier family 22 member 6, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A6Q4U2R8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC22A6Q4U2R8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC22A6Q4U2R8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC22A6Q4U2R8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC22A6Q4U2R8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC22A6Q4U2R8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC22A6Q4U2R8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC22A6Q4U2R8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC22A6Q4U2R8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC22A6Q4U2R8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC22A6Q4U2R8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC22A6Q4U2R8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC22A6Q4U2R8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC22A6Q4U2R8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC22A6Q4U2R8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC22A6Q4U2R8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC22A6Q4U2R8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC22A6Q4U2R8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC22A6Q4U2R8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC22A6Q4U2R8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC22A6Q4U2R8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC22A6Q4U2R8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC22A6Q4U2R8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC22A6Q4U2R8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC22A6Q4U2R8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC22A6Q4U2R8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC22A6Q4U2R8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC22A6Q4U2R8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC22A6Q4U2R8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC22A6Q4U2R8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC22A6Q4U2R8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC22A6Q4U2R8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC22A6Q4U2R8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC22A6Q4U2R8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC22A6Q4U2R8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC22A6Q4U2R8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC22A6Q4U2R8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC22A6Q4U2R8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC22A6Q4U2R8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC22A6Q4U2R8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC22A6Q4U2R8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC22A6Q4U2R8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC22A6Q4U2R8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC22A6Q4U2R8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC22A6Q4U2R8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC22A6Q4U2R8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC22A6Q4U2R8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC22A6Q4U2R8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC22A6Q4U2R8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC22A6Q4U2R8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC22A6Q4U2R8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC22A6Q4U2R8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC22A6Q4U2R8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC22A6Q4U2R8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC22A6Q4U2R8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC22A6Q4U2R8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC22A6Q4U2R8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC22A6Q4U2R8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC22A6Q4U2R8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC22A6Q4U2R8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC22A6Q4U2R8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC22A6Q4U2R8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC22A6Q4U2R8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC22A6Q4U2R8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC22A6Q4U2R8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC22A6Q4U2R8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC22A6Q4U2R8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC22A6Q4U2R8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC22A6Q4U2R8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC22A6Q4U2R8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC22A6Q4U2R8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC22A6Q4U2R8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC22A6Q4U2R8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC22A6Q4U2R8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC22A6Q4U2R8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC22A6Q4U2R8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC22A6Q4U2R8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC22A6Q4U2R8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC22A6Q4U2R8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC22A6Q4U2R8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC22A6Q4U2R8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC22A6Q4U2R8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC22A6Q4U2R8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC22A6Q4U2R8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC22A6Q4U2R8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC22A6Q4U2R8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC22A6Q4U2R8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC22A6Q4U2R8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC22A6Q4U2R8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC22A6Q4U2R8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC22A6Q4U2R8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC22A6Q4U2R8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC22A6Q4U2R8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC22A6Q4U2R8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC22A6Q4U2R8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC22A6Q4U2R8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC22A6Q4U2R8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC22A6Q4U2R8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC22A6Q4U2R8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC22A6Q4U2R8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms