Protein–RNA interactions for Protein: Q4G176

ACSF3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSF3Q4G176 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACSF3Q4G176 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACSF3Q4G176 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACSF3Q4G176 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACSF3Q4G176 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACSF3Q4G176 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACSF3Q4G176 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACSF3Q4G176 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACSF3Q4G176 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACSF3Q4G176 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACSF3Q4G176 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACSF3Q4G176 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACSF3Q4G176 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACSF3Q4G176 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACSF3Q4G176 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACSF3Q4G176 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACSF3Q4G176 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACSF3Q4G176 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACSF3Q4G176 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACSF3Q4G176 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACSF3Q4G176 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACSF3Q4G176 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACSF3Q4G176 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACSF3Q4G176 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACSF3Q4G176 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACSF3Q4G176 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACSF3Q4G176 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ACSF3Q4G176 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ACSF3Q4G176 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ACSF3Q4G176 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACSF3Q4G176 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACSF3Q4G176 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACSF3Q4G176 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACSF3Q4G176 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACSF3Q4G176 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACSF3Q4G176 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACSF3Q4G176 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACSF3Q4G176 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACSF3Q4G176 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACSF3Q4G176 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ACSF3Q4G176 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACSF3Q4G176 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACSF3Q4G176 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACSF3Q4G176 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACSF3Q4G176 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACSF3Q4G176 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACSF3Q4G176 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ACSF3Q4G176 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACSF3Q4G176 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACSF3Q4G176 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACSF3Q4G176 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACSF3Q4G176 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACSF3Q4G176 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACSF3Q4G176 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACSF3Q4G176 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACSF3Q4G176 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACSF3Q4G176 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACSF3Q4G176 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACSF3Q4G176 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACSF3Q4G176 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACSF3Q4G176 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACSF3Q4G176 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACSF3Q4G176 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACSF3Q4G176 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACSF3Q4G176 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACSF3Q4G176 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACSF3Q4G176 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACSF3Q4G176 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACSF3Q4G176 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACSF3Q4G176 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACSF3Q4G176 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACSF3Q4G176 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACSF3Q4G176 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACSF3Q4G176 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACSF3Q4G176 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACSF3Q4G176 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ACSF3Q4G176 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACSF3Q4G176 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACSF3Q4G176 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACSF3Q4G176 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACSF3Q4G176 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACSF3Q4G176 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACSF3Q4G176 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ACSF3Q4G176 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACSF3Q4G176 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACSF3Q4G176 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACSF3Q4G176 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACSF3Q4G176 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACSF3Q4G176 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACSF3Q4G176 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACSF3Q4G176 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACSF3Q4G176 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACSF3Q4G176 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACSF3Q4G176 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACSF3Q4G176 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACSF3Q4G176 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACSF3Q4G176 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACSF3Q4G176 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACSF3Q4G176 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACSF3Q4G176 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms