Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI77

KRTAP13-4, Keratin-associated protein 13-4, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-4Q3LI77 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
KRTAP13-4Q3LI77 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
KRTAP13-4Q3LI77 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
KRTAP13-4Q3LI77 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
KRTAP13-4Q3LI77 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
KRTAP13-4Q3LI77 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP13-4Q3LI77 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP13-4Q3LI77 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP13-4Q3LI77 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
KRTAP13-4Q3LI77 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP13-4Q3LI77 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP13-4Q3LI77 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP13-4Q3LI77 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP13-4Q3LI77 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP13-4Q3LI77 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
KRTAP13-4Q3LI77 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
KRTAP13-4Q3LI77 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
KRTAP13-4Q3LI77 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
KRTAP13-4Q3LI77 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
KRTAP13-4Q3LI77 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
KRTAP13-4Q3LI77 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP13-4Q3LI77 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP13-4Q3LI77 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
KRTAP13-4Q3LI77 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP13-4Q3LI77 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP13-4Q3LI77 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP13-4Q3LI77 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP13-4Q3LI77 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP13-4Q3LI77 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
KRTAP13-4Q3LI77 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
KRTAP13-4Q3LI77 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
KRTAP13-4Q3LI77 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
KRTAP13-4Q3LI77 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
KRTAP13-4Q3LI77 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP13-4Q3LI77 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP13-4Q3LI77 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
KRTAP13-4Q3LI77 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP13-4Q3LI77 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP13-4Q3LI77 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP13-4Q3LI77 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP13-4Q3LI77 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP13-4Q3LI77 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP13-4Q3LI77 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP13-4Q3LI77 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP13-4Q3LI77 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP13-4Q3LI77 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP13-4Q3LI77 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP13-4Q3LI77 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP13-4Q3LI77 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP13-4Q3LI77 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP13-4Q3LI77 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP13-4Q3LI77 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP13-4Q3LI77 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
KRTAP13-4Q3LI77 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP13-4Q3LI77 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP13-4Q3LI77 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP13-4Q3LI77 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
KRTAP13-4Q3LI77 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP13-4Q3LI77 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP13-4Q3LI77 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP13-4Q3LI77 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP13-4Q3LI77 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP13-4Q3LI77 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP13-4Q3LI77 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KRTAP13-4Q3LI77 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP13-4Q3LI77 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP13-4Q3LI77 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP13-4Q3LI77 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP13-4Q3LI77 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP13-4Q3LI77 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KRTAP13-4Q3LI77 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP13-4Q3LI77 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP13-4Q3LI77 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP13-4Q3LI77 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP13-4Q3LI77 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP13-4Q3LI77 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KRTAP13-4Q3LI77 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
KRTAP13-4Q3LI77 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
KRTAP13-4Q3LI77 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP13-4Q3LI77 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP13-4Q3LI77 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP13-4Q3LI77 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP13-4Q3LI77 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP13-4Q3LI77 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KRTAP13-4Q3LI77 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
KRTAP13-4Q3LI77 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
KRTAP13-4Q3LI77 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
KRTAP13-4Q3LI77 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
KRTAP13-4Q3LI77 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
KRTAP13-4Q3LI77 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
KRTAP13-4Q3LI77 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
KRTAP13-4Q3LI77 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP13-4Q3LI77 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP13-4Q3LI77 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP13-4Q3LI77 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP13-4Q3LI77 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
KRTAP13-4Q3LI77 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP13-4Q3LI77 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
KRTAP13-4Q3LI77 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms