Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI77

KRTAP13-4, Keratin-associated protein 13-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-4Q3LI77 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP13-4Q3LI77 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KRTAP13-4Q3LI77 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
KRTAP13-4Q3LI77 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP13-4Q3LI77 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP13-4Q3LI77 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRTAP13-4Q3LI77 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP13-4Q3LI77 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP13-4Q3LI77 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP13-4Q3LI77 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP13-4Q3LI77 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP13-4Q3LI77 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP13-4Q3LI77 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KRTAP13-4Q3LI77 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KRTAP13-4Q3LI77 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KRTAP13-4Q3LI77 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
KRTAP13-4Q3LI77 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
KRTAP13-4Q3LI77 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KRTAP13-4Q3LI77 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KRTAP13-4Q3LI77 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KRTAP13-4Q3LI77 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP13-4Q3LI77 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRTAP13-4Q3LI77 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KRTAP13-4Q3LI77 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KRTAP13-4Q3LI77 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KRTAP13-4Q3LI77 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
KRTAP13-4Q3LI77 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
KRTAP13-4Q3LI77 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
KRTAP13-4Q3LI77 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
KRTAP13-4Q3LI77 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
KRTAP13-4Q3LI77 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KRTAP13-4Q3LI77 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KRTAP13-4Q3LI77 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KRTAP13-4Q3LI77 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
KRTAP13-4Q3LI77 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KRTAP13-4Q3LI77 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KRTAP13-4Q3LI77 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KRTAP13-4Q3LI77 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
KRTAP13-4Q3LI77 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
KRTAP13-4Q3LI77 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KRTAP13-4Q3LI77 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KRTAP13-4Q3LI77 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KRTAP13-4Q3LI77 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
KRTAP13-4Q3LI77 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
KRTAP13-4Q3LI77 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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KRTAP13-4Q3LI77 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
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KRTAP13-4Q3LI77 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
KRTAP13-4Q3LI77 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
KRTAP13-4Q3LI77 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
KRTAP13-4Q3LI77 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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KRTAP13-4Q3LI77 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
KRTAP13-4Q3LI77 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
KRTAP13-4Q3LI77 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KRTAP13-4Q3LI77 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KRTAP13-4Q3LI77 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KRTAP13-4Q3LI77 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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KRTAP13-4Q3LI77 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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KRTAP13-4Q3LI77 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP13-4Q3LI77 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP13-4Q3LI77 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
KRTAP13-4Q3LI77 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KRTAP13-4Q3LI77 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
KRTAP13-4Q3LI77 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
KRTAP13-4Q3LI77 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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KRTAP13-4Q3LI77 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KRTAP13-4Q3LI77 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KRTAP13-4Q3LI77 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP13-4Q3LI77 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP13-4Q3LI77 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP13-4Q3LI77 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP13-4Q3LI77 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP13-4Q3LI77 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KRTAP13-4Q3LI77 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KRTAP13-4Q3LI77 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
KRTAP13-4Q3LI77 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP13-4Q3LI77 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP13-4Q3LI77 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KRTAP13-4Q3LI77 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KRTAP13-4Q3LI77 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KRTAP13-4Q3LI77 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KRTAP13-4Q3LI77 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP13-4Q3LI77 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP13-4Q3LI77 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP13-4Q3LI77 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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