Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KLHL38Q2WGJ6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KLHL38Q2WGJ6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KLHL38Q2WGJ6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KLHL38Q2WGJ6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KLHL38Q2WGJ6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KLHL38Q2WGJ6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KLHL38Q2WGJ6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KLHL38Q2WGJ6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KLHL38Q2WGJ6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KLHL38Q2WGJ6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KLHL38Q2WGJ6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KLHL38Q2WGJ6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KLHL38Q2WGJ6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KLHL38Q2WGJ6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KLHL38Q2WGJ6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KLHL38Q2WGJ6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KLHL38Q2WGJ6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KLHL38Q2WGJ6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KLHL38Q2WGJ6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KLHL38Q2WGJ6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KLHL38Q2WGJ6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KLHL38Q2WGJ6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KLHL38Q2WGJ6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KLHL38Q2WGJ6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KLHL38Q2WGJ6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KLHL38Q2WGJ6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KLHL38Q2WGJ6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KLHL38Q2WGJ6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KLHL38Q2WGJ6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
KLHL38Q2WGJ6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KLHL38Q2WGJ6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KLHL38Q2WGJ6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KLHL38Q2WGJ6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KLHL38Q2WGJ6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KLHL38Q2WGJ6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KLHL38Q2WGJ6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KLHL38Q2WGJ6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
KLHL38Q2WGJ6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
KLHL38Q2WGJ6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KLHL38Q2WGJ6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KLHL38Q2WGJ6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KLHL38Q2WGJ6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KLHL38Q2WGJ6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KLHL38Q2WGJ6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KLHL38Q2WGJ6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KLHL38Q2WGJ6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KLHL38Q2WGJ6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KLHL38Q2WGJ6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KLHL38Q2WGJ6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KLHL38Q2WGJ6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KLHL38Q2WGJ6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KLHL38Q2WGJ6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KLHL38Q2WGJ6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KLHL38Q2WGJ6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KLHL38Q2WGJ6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KLHL38Q2WGJ6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KLHL38Q2WGJ6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KLHL38Q2WGJ6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KLHL38Q2WGJ6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KLHL38Q2WGJ6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KLHL38Q2WGJ6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KLHL38Q2WGJ6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KLHL38Q2WGJ6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
KLHL38Q2WGJ6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KLHL38Q2WGJ6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KLHL38Q2WGJ6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KLHL38Q2WGJ6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
KLHL38Q2WGJ6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KLHL38Q2WGJ6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KLHL38Q2WGJ6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KLHL38Q2WGJ6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KLHL38Q2WGJ6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
KLHL38Q2WGJ6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KLHL38Q2WGJ6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KLHL38Q2WGJ6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KLHL38Q2WGJ6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KLHL38Q2WGJ6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KLHL38Q2WGJ6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
KLHL38Q2WGJ6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KLHL38Q2WGJ6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KLHL38Q2WGJ6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KLHL38Q2WGJ6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KLHL38Q2WGJ6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
KLHL38Q2WGJ6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KLHL38Q2WGJ6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KLHL38Q2WGJ6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KLHL38Q2WGJ6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KLHL38Q2WGJ6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KLHL38Q2WGJ6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KLHL38Q2WGJ6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KLHL38Q2WGJ6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KLHL38Q2WGJ6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KLHL38Q2WGJ6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KLHL38Q2WGJ6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KLHL38Q2WGJ6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KLHL38Q2WGJ6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
KLHL38Q2WGJ6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
KLHL38Q2WGJ6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHL38Q2WGJ6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms