Protein–RNA interactions for Protein: Q2QD12

RPEL1, Ribulose-phosphate 3-epimerase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPEL1Q2QD12 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPEL1Q2QD12 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPEL1Q2QD12 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPEL1Q2QD12 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPEL1Q2QD12 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RPEL1Q2QD12 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPEL1Q2QD12 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPEL1Q2QD12 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPEL1Q2QD12 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPEL1Q2QD12 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPEL1Q2QD12 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPEL1Q2QD12 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RPEL1Q2QD12 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPEL1Q2QD12 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPEL1Q2QD12 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPEL1Q2QD12 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPEL1Q2QD12 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RPEL1Q2QD12 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPEL1Q2QD12 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPEL1Q2QD12 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPEL1Q2QD12 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPEL1Q2QD12 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPEL1Q2QD12 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPEL1Q2QD12 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPEL1Q2QD12 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPEL1Q2QD12 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPEL1Q2QD12 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPEL1Q2QD12 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPEL1Q2QD12 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPEL1Q2QD12 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPEL1Q2QD12 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPEL1Q2QD12 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPEL1Q2QD12 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPEL1Q2QD12 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPEL1Q2QD12 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPEL1Q2QD12 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPEL1Q2QD12 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPEL1Q2QD12 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RPEL1Q2QD12 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPEL1Q2QD12 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPEL1Q2QD12 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RPEL1Q2QD12 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
RPEL1Q2QD12 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RPEL1Q2QD12 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPEL1Q2QD12 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPEL1Q2QD12 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPEL1Q2QD12 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RPEL1Q2QD12 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPEL1Q2QD12 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPEL1Q2QD12 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPEL1Q2QD12 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RPEL1Q2QD12 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RPEL1Q2QD12 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPEL1Q2QD12 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPEL1Q2QD12 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RPEL1Q2QD12 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RPEL1Q2QD12 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPEL1Q2QD12 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RPEL1Q2QD12 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPEL1Q2QD12 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPEL1Q2QD12 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RPEL1Q2QD12 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPEL1Q2QD12 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPEL1Q2QD12 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RPEL1Q2QD12 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPEL1Q2QD12 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPEL1Q2QD12 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPEL1Q2QD12 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPEL1Q2QD12 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPEL1Q2QD12 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPEL1Q2QD12 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPEL1Q2QD12 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPEL1Q2QD12 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPEL1Q2QD12 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPEL1Q2QD12 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
RPEL1Q2QD12 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPEL1Q2QD12 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPEL1Q2QD12 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPEL1Q2QD12 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPEL1Q2QD12 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPEL1Q2QD12 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPEL1Q2QD12 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPEL1Q2QD12 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPEL1Q2QD12 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPEL1Q2QD12 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPEL1Q2QD12 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPEL1Q2QD12 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPEL1Q2QD12 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPEL1Q2QD12 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPEL1Q2QD12 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPEL1Q2QD12 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPEL1Q2QD12 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPEL1Q2QD12 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPEL1Q2QD12 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPEL1Q2QD12 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPEL1Q2QD12 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPEL1Q2QD12 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPEL1Q2QD12 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RPEL1Q2QD12 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RPEL1Q2QD12 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms