Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHT4

GSG1, Germ cell-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSG1Q2KHT4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GSG1Q2KHT4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GSG1Q2KHT4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GSG1Q2KHT4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GSG1Q2KHT4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
GSG1Q2KHT4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GSG1Q2KHT4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GSG1Q2KHT4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GSG1Q2KHT4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GSG1Q2KHT4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GSG1Q2KHT4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GSG1Q2KHT4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GSG1Q2KHT4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GSG1Q2KHT4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GSG1Q2KHT4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GSG1Q2KHT4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GSG1Q2KHT4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GSG1Q2KHT4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GSG1Q2KHT4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GSG1Q2KHT4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GSG1Q2KHT4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GSG1Q2KHT4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GSG1Q2KHT4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GSG1Q2KHT4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GSG1Q2KHT4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GSG1Q2KHT4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GSG1Q2KHT4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSG1Q2KHT4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GSG1Q2KHT4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GSG1Q2KHT4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GSG1Q2KHT4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GSG1Q2KHT4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GSG1Q2KHT4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GSG1Q2KHT4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GSG1Q2KHT4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GSG1Q2KHT4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GSG1Q2KHT4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GSG1Q2KHT4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GSG1Q2KHT4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GSG1Q2KHT4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GSG1Q2KHT4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GSG1Q2KHT4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GSG1Q2KHT4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GSG1Q2KHT4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GSG1Q2KHT4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GSG1Q2KHT4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GSG1Q2KHT4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GSG1Q2KHT4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GSG1Q2KHT4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GSG1Q2KHT4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GSG1Q2KHT4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GSG1Q2KHT4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GSG1Q2KHT4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GSG1Q2KHT4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GSG1Q2KHT4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GSG1Q2KHT4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GSG1Q2KHT4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GSG1Q2KHT4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GSG1Q2KHT4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GSG1Q2KHT4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GSG1Q2KHT4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GSG1Q2KHT4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GSG1Q2KHT4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GSG1Q2KHT4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GSG1Q2KHT4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GSG1Q2KHT4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSG1Q2KHT4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSG1Q2KHT4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GSG1Q2KHT4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSG1Q2KHT4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSG1Q2KHT4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSG1Q2KHT4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSG1Q2KHT4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSG1Q2KHT4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSG1Q2KHT4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSG1Q2KHT4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSG1Q2KHT4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSG1Q2KHT4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GSG1Q2KHT4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GSG1Q2KHT4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GSG1Q2KHT4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GSG1Q2KHT4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GSG1Q2KHT4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GSG1Q2KHT4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GSG1Q2KHT4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSG1Q2KHT4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSG1Q2KHT4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSG1Q2KHT4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSG1Q2KHT4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSG1Q2KHT4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSG1Q2KHT4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSG1Q2KHT4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GSG1Q2KHT4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GSG1Q2KHT4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSG1Q2KHT4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSG1Q2KHT4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GSG1Q2KHT4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GSG1Q2KHT4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GSG1Q2KHT4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GSG1Q2KHT4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms