Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Length 503 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NRF1Q16656 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NRF1Q16656 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRF1Q16656 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NRF1Q16656 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NRF1Q16656 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NRF1Q16656 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NRF1Q16656 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NRF1Q16656 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NRF1Q16656 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NRF1Q16656 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NRF1Q16656 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NRF1Q16656 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NRF1Q16656 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NRF1Q16656 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NRF1Q16656 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NRF1Q16656 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NRF1Q16656 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NRF1Q16656 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NRF1Q16656 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NRF1Q16656 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NRF1Q16656 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NRF1Q16656 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NRF1Q16656 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NRF1Q16656 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NRF1Q16656 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NRF1Q16656 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NRF1Q16656 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NRF1Q16656 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NRF1Q16656 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NRF1Q16656 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NRF1Q16656 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NRF1Q16656 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRF1Q16656 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRF1Q16656 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRF1Q16656 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRF1Q16656 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRF1Q16656 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NRF1Q16656 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NRF1Q16656 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NRF1Q16656 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NRF1Q16656 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NRF1Q16656 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NRF1Q16656 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NRF1Q16656 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NRF1Q16656 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NRF1Q16656 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NRF1Q16656 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NRF1Q16656 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NRF1Q16656 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
NRF1Q16656 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NRF1Q16656 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NRF1Q16656 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NRF1Q16656 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NRF1Q16656 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRF1Q16656 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRF1Q16656 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRF1Q16656 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRF1Q16656 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRF1Q16656 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRF1Q16656 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRF1Q16656 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NRF1Q16656 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRF1Q16656 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRF1Q16656 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRF1Q16656 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRF1Q16656 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRF1Q16656 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRF1Q16656 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRF1Q16656 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NRF1Q16656 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NRF1Q16656 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NRF1Q16656 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
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NRF1Q16656 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NRF1Q16656 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NRF1Q16656 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRF1Q16656 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRF1Q16656 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRF1Q16656 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRF1Q16656 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRF1Q16656 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRF1Q16656 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRF1Q16656 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRF1Q16656 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRF1Q16656 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRF1Q16656 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRF1Q16656 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NRF1Q16656 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NRF1Q16656 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NRF1Q16656 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NRF1Q16656 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NRF1Q16656 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NRF1Q16656 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NRF1Q16656 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRF1Q16656 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRF1Q16656 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRF1Q16656 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NRF1Q16656 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NRF1Q16656 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
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