Protein–RNA interactions for Protein: Q15293

RCN1, Reticulocalbin-1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN1Q15293 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RCN1Q15293 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RCN1Q15293 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RCN1Q15293 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RCN1Q15293 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RCN1Q15293 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RCN1Q15293 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RCN1Q15293 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RCN1Q15293 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RCN1Q15293 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RCN1Q15293 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RCN1Q15293 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RCN1Q15293 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RCN1Q15293 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RCN1Q15293 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RCN1Q15293 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RCN1Q15293 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RCN1Q15293 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RCN1Q15293 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RCN1Q15293 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RCN1Q15293 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RCN1Q15293 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RCN1Q15293 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RCN1Q15293 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RCN1Q15293 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RCN1Q15293 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RCN1Q15293 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RCN1Q15293 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RCN1Q15293 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RCN1Q15293 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RCN1Q15293 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RCN1Q15293 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RCN1Q15293 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RCN1Q15293 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RCN1Q15293 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RCN1Q15293 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RCN1Q15293 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RCN1Q15293 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RCN1Q15293 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RCN1Q15293 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RCN1Q15293 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RCN1Q15293 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RCN1Q15293 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RCN1Q15293 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RCN1Q15293 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RCN1Q15293 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RCN1Q15293 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RCN1Q15293 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RCN1Q15293 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCN1Q15293 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCN1Q15293 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCN1Q15293 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RCN1Q15293 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RCN1Q15293 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RCN1Q15293 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RCN1Q15293 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RCN1Q15293 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RCN1Q15293 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RCN1Q15293 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RCN1Q15293 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCN1Q15293 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCN1Q15293 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RCN1Q15293 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RCN1Q15293 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RCN1Q15293 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RCN1Q15293 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RCN1Q15293 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RCN1Q15293 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RCN1Q15293 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RCN1Q15293 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RCN1Q15293 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RCN1Q15293 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RCN1Q15293 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RCN1Q15293 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RCN1Q15293 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RCN1Q15293 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RCN1Q15293 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RCN1Q15293 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RCN1Q15293 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RCN1Q15293 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RCN1Q15293 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RCN1Q15293 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RCN1Q15293 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RCN1Q15293 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RCN1Q15293 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RCN1Q15293 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCN1Q15293 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCN1Q15293 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCN1Q15293 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCN1Q15293 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCN1Q15293 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RCN1Q15293 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RCN1Q15293 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RCN1Q15293 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RCN1Q15293 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RCN1Q15293 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RCN1Q15293 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RCN1Q15293 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RCN1Q15293 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RCN1Q15293 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
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