Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAPTM4AQ15012 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAPTM4AQ15012 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAPTM4AQ15012 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAPTM4AQ15012 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAPTM4AQ15012 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAPTM4AQ15012 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAPTM4AQ15012 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAPTM4AQ15012 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAPTM4AQ15012 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAPTM4AQ15012 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAPTM4AQ15012 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAPTM4AQ15012 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAPTM4AQ15012 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAPTM4AQ15012 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAPTM4AQ15012 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAPTM4AQ15012 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAPTM4AQ15012 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAPTM4AQ15012 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAPTM4AQ15012 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAPTM4AQ15012 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAPTM4AQ15012 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAPTM4AQ15012 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAPTM4AQ15012 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAPTM4AQ15012 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LAPTM4AQ15012 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LAPTM4AQ15012 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LAPTM4AQ15012 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAPTM4AQ15012 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAPTM4AQ15012 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LAPTM4AQ15012 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAPTM4AQ15012 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAPTM4AQ15012 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAPTM4AQ15012 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAPTM4AQ15012 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAPTM4AQ15012 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAPTM4AQ15012 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAPTM4AQ15012 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LAPTM4AQ15012 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LAPTM4AQ15012 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LAPTM4AQ15012 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAPTM4AQ15012 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LAPTM4AQ15012 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAPTM4AQ15012 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAPTM4AQ15012 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAPTM4AQ15012 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAPTM4AQ15012 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAPTM4AQ15012 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LAPTM4AQ15012 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAPTM4AQ15012 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAPTM4AQ15012 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAPTM4AQ15012 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LAPTM4AQ15012 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAPTM4AQ15012 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LAPTM4AQ15012 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAPTM4AQ15012 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAPTM4AQ15012 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LAPTM4AQ15012 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LAPTM4AQ15012 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAPTM4AQ15012 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LAPTM4AQ15012 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAPTM4AQ15012 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAPTM4AQ15012 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAPTM4AQ15012 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LAPTM4AQ15012 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAPTM4AQ15012 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAPTM4AQ15012 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAPTM4AQ15012 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAPTM4AQ15012 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAPTM4AQ15012 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAPTM4AQ15012 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAPTM4AQ15012 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAPTM4AQ15012 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LAPTM4AQ15012 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAPTM4AQ15012 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAPTM4AQ15012 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAPTM4AQ15012 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAPTM4AQ15012 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAPTM4AQ15012 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAPTM4AQ15012 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAPTM4AQ15012 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAPTM4AQ15012 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAPTM4AQ15012 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAPTM4AQ15012 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAPTM4AQ15012 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAPTM4AQ15012 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAPTM4AQ15012 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAPTM4AQ15012 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LAPTM4AQ15012 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LAPTM4AQ15012 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAPTM4AQ15012 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAPTM4AQ15012 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LAPTM4AQ15012 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAPTM4AQ15012 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LAPTM4AQ15012 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LAPTM4AQ15012 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LAPTM4AQ15012 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAPTM4AQ15012 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAPTM4AQ15012 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LAPTM4AQ15012 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
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