Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GTF2H3Q13889 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GTF2H3Q13889 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GTF2H3Q13889 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GTF2H3Q13889 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF2H3Q13889 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF2H3Q13889 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF2H3Q13889 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF2H3Q13889 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF2H3Q13889 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF2H3Q13889 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF2H3Q13889 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF2H3Q13889 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF2H3Q13889 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF2H3Q13889 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF2H3Q13889 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF2H3Q13889 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF2H3Q13889 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF2H3Q13889 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF2H3Q13889 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF2H3Q13889 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF2H3Q13889 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF2H3Q13889 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF2H3Q13889 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF2H3Q13889 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF2H3Q13889 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
GTF2H3Q13889 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GTF2H3Q13889 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GTF2H3Q13889 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GTF2H3Q13889 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF2H3Q13889 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF2H3Q13889 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF2H3Q13889 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF2H3Q13889 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF2H3Q13889 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF2H3Q13889 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF2H3Q13889 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF2H3Q13889 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF2H3Q13889 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF2H3Q13889 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF2H3Q13889 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GTF2H3Q13889 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
GTF2H3Q13889 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GTF2H3Q13889 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GTF2H3Q13889 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GTF2H3Q13889 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GTF2H3Q13889 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GTF2H3Q13889 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GTF2H3Q13889 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF2H3Q13889 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF2H3Q13889 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF2H3Q13889 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF2H3Q13889 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF2H3Q13889 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF2H3Q13889 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF2H3Q13889 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF2H3Q13889 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF2H3Q13889 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF2H3Q13889 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF2H3Q13889 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF2H3Q13889 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF2H3Q13889 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF2H3Q13889 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF2H3Q13889 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF2H3Q13889 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GTF2H3Q13889 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
GTF2H3Q13889 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GTF2H3Q13889 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF2H3Q13889 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF2H3Q13889 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF2H3Q13889 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF2H3Q13889 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF2H3Q13889 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF2H3Q13889 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF2H3Q13889 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF2H3Q13889 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF2H3Q13889 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF2H3Q13889 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF2H3Q13889 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF2H3Q13889 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF2H3Q13889 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF2H3Q13889 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF2H3Q13889 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF2H3Q13889 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF2H3Q13889 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF2H3Q13889 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF2H3Q13889 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GTF2H3Q13889 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GTF2H3Q13889 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF2H3Q13889 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF2H3Q13889 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF2H3Q13889 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF2H3Q13889 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF2H3Q13889 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF2H3Q13889 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF2H3Q13889 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF2H3Q13889 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF2H3Q13889 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF2H3Q13889 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF2H3Q13889 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
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