Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CUL3Q13618 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CUL3Q13618 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CUL3Q13618 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CUL3Q13618 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CUL3Q13618 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CUL3Q13618 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CUL3Q13618 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CUL3Q13618 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CUL3Q13618 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CUL3Q13618 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CUL3Q13618 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CUL3Q13618 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CUL3Q13618 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CUL3Q13618 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CUL3Q13618 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CUL3Q13618 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CUL3Q13618 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CUL3Q13618 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CUL3Q13618 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CUL3Q13618 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CUL3Q13618 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CUL3Q13618 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CUL3Q13618 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CUL3Q13618 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CUL3Q13618 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CUL3Q13618 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CUL3Q13618 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CUL3Q13618 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CUL3Q13618 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CUL3Q13618 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CUL3Q13618 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CUL3Q13618 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CUL3Q13618 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CUL3Q13618 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CUL3Q13618 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CUL3Q13618 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CUL3Q13618 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CUL3Q13618 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CUL3Q13618 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CUL3Q13618 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CUL3Q13618 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CUL3Q13618 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CUL3Q13618 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CUL3Q13618 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CUL3Q13618 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CUL3Q13618 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CUL3Q13618 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CUL3Q13618 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CUL3Q13618 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CUL3Q13618 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CUL3Q13618 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CUL3Q13618 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CUL3Q13618 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CUL3Q13618 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CUL3Q13618 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CUL3Q13618 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CUL3Q13618 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CUL3Q13618 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CUL3Q13618 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CUL3Q13618 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CUL3Q13618 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CUL3Q13618 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CUL3Q13618 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CUL3Q13618 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CUL3Q13618 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CUL3Q13618 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CUL3Q13618 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CUL3Q13618 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CUL3Q13618 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CUL3Q13618 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CUL3Q13618 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CUL3Q13618 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CUL3Q13618 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CUL3Q13618 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CUL3Q13618 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CUL3Q13618 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CUL3Q13618 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CUL3Q13618 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CUL3Q13618 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CUL3Q13618 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CUL3Q13618 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CUL3Q13618 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CUL3Q13618 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CUL3Q13618 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CUL3Q13618 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CUL3Q13618 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CUL3Q13618 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CUL3Q13618 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CUL3Q13618 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CUL3Q13618 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CUL3Q13618 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CUL3Q13618 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CUL3Q13618 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CUL3Q13618 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CUL3Q13618 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CUL3Q13618 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CUL3Q13618 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CUL3Q13618 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CUL3Q13618 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
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