Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EIF4EBP1Q13541 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EIF4EBP1Q13541 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EIF4EBP1Q13541 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EIF4EBP1Q13541 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EIF4EBP1Q13541 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EIF4EBP1Q13541 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EIF4EBP1Q13541 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EIF4EBP1Q13541 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EIF4EBP1Q13541 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EIF4EBP1Q13541 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EIF4EBP1Q13541 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EIF4EBP1Q13541 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
EIF4EBP1Q13541 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EIF4EBP1Q13541 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EIF4EBP1Q13541 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EIF4EBP1Q13541 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EIF4EBP1Q13541 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EIF4EBP1Q13541 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EIF4EBP1Q13541 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EIF4EBP1Q13541 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
EIF4EBP1Q13541 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF4EBP1Q13541 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EIF4EBP1Q13541 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EIF4EBP1Q13541 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF4EBP1Q13541 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF4EBP1Q13541 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF4EBP1Q13541 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF4EBP1Q13541 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EIF4EBP1Q13541 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF4EBP1Q13541 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF4EBP1Q13541 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EIF4EBP1Q13541 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF4EBP1Q13541 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF4EBP1Q13541 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF4EBP1Q13541 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF4EBP1Q13541 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EIF4EBP1Q13541 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF4EBP1Q13541 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF4EBP1Q13541 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EIF4EBP1Q13541 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF4EBP1Q13541 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF4EBP1Q13541 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EIF4EBP1Q13541 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EIF4EBP1Q13541 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EIF4EBP1Q13541 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EIF4EBP1Q13541 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EIF4EBP1Q13541 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EIF4EBP1Q13541 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EIF4EBP1Q13541 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF4EBP1Q13541 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF4EBP1Q13541 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF4EBP1Q13541 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EIF4EBP1Q13541 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF4EBP1Q13541 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EIF4EBP1Q13541 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF4EBP1Q13541 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EIF4EBP1Q13541 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EIF4EBP1Q13541 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EIF4EBP1Q13541 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF4EBP1Q13541 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF4EBP1Q13541 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF4EBP1Q13541 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EIF4EBP1Q13541 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF4EBP1Q13541 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EIF4EBP1Q13541 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EIF4EBP1Q13541 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF4EBP1Q13541 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF4EBP1Q13541 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EIF4EBP1Q13541 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF4EBP1Q13541 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EIF4EBP1Q13541 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF4EBP1Q13541 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EIF4EBP1Q13541 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF4EBP1Q13541 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF4EBP1Q13541 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF4EBP1Q13541 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EIF4EBP1Q13541 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
EIF4EBP1Q13541 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EIF4EBP1Q13541 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EIF4EBP1Q13541 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EIF4EBP1Q13541 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EIF4EBP1Q13541 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EIF4EBP1Q13541 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EIF4EBP1Q13541 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EIF4EBP1Q13541 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EIF4EBP1Q13541 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EIF4EBP1Q13541 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EIF4EBP1Q13541 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EIF4EBP1Q13541 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EIF4EBP1Q13541 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EIF4EBP1Q13541 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EIF4EBP1Q13541 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
EIF4EBP1Q13541 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EIF4EBP1Q13541 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF4EBP1Q13541 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF4EBP1Q13541 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF4EBP1Q13541 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF4EBP1Q13541 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
EIF4EBP1Q13541 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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