Protein–RNA interactions for Protein: Q13506

NAB1, NGFI-A-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAB1Q13506 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NAB1Q13506 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NAB1Q13506 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NAB1Q13506 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NAB1Q13506 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NAB1Q13506 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NAB1Q13506 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NAB1Q13506 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NAB1Q13506 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NAB1Q13506 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NAB1Q13506 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NAB1Q13506 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NAB1Q13506 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NAB1Q13506 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NAB1Q13506 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NAB1Q13506 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NAB1Q13506 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NAB1Q13506 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NAB1Q13506 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NAB1Q13506 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NAB1Q13506 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NAB1Q13506 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NAB1Q13506 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
NAB1Q13506 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NAB1Q13506 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NAB1Q13506 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NAB1Q13506 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NAB1Q13506 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NAB1Q13506 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NAB1Q13506 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NAB1Q13506 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NAB1Q13506 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NAB1Q13506 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NAB1Q13506 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NAB1Q13506 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NAB1Q13506 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NAB1Q13506 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NAB1Q13506 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NAB1Q13506 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NAB1Q13506 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NAB1Q13506 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NAB1Q13506 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NAB1Q13506 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NAB1Q13506 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NAB1Q13506 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NAB1Q13506 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NAB1Q13506 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NAB1Q13506 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NAB1Q13506 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NAB1Q13506 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NAB1Q13506 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NAB1Q13506 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NAB1Q13506 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NAB1Q13506 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NAB1Q13506 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NAB1Q13506 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NAB1Q13506 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NAB1Q13506 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NAB1Q13506 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NAB1Q13506 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NAB1Q13506 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NAB1Q13506 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NAB1Q13506 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NAB1Q13506 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NAB1Q13506 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NAB1Q13506 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NAB1Q13506 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NAB1Q13506 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NAB1Q13506 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NAB1Q13506 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NAB1Q13506 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NAB1Q13506 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NAB1Q13506 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NAB1Q13506 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NAB1Q13506 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NAB1Q13506 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NAB1Q13506 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NAB1Q13506 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NAB1Q13506 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NAB1Q13506 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NAB1Q13506 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NAB1Q13506 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NAB1Q13506 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NAB1Q13506 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NAB1Q13506 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NAB1Q13506 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NAB1Q13506 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NAB1Q13506 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NAB1Q13506 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NAB1Q13506 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NAB1Q13506 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NAB1Q13506 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
NAB1Q13506 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NAB1Q13506 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NAB1Q13506 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NAB1Q13506 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
NAB1Q13506 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NAB1Q13506 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NAB1Q13506 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NAB1Q13506 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms