Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MSLNQ13421 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MSLNQ13421 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MSLNQ13421 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MSLNQ13421 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MSLNQ13421 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MSLNQ13421 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MSLNQ13421 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MSLNQ13421 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MSLNQ13421 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MSLNQ13421 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
MSLNQ13421 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MSLNQ13421 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MSLNQ13421 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MSLNQ13421 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MSLNQ13421 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MSLNQ13421 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MSLNQ13421 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MSLNQ13421 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MSLNQ13421 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MSLNQ13421 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MSLNQ13421 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MSLNQ13421 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MSLNQ13421 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MSLNQ13421 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MSLNQ13421 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MSLNQ13421 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MSLNQ13421 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MSLNQ13421 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MSLNQ13421 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
MSLNQ13421 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MSLNQ13421 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MSLNQ13421 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
MSLNQ13421 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MSLNQ13421 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MSLNQ13421 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MSLNQ13421 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MSLNQ13421 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MSLNQ13421 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MSLNQ13421 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MSLNQ13421 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
MSLNQ13421 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MSLNQ13421 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MSLNQ13421 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MSLNQ13421 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
MSLNQ13421 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MSLNQ13421 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MSLNQ13421 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MSLNQ13421 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MSLNQ13421 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MSLNQ13421 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MSLNQ13421 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MSLNQ13421 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MSLNQ13421 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MSLNQ13421 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MSLNQ13421 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MSLNQ13421 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MSLNQ13421 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MSLNQ13421 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MSLNQ13421 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MSLNQ13421 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MSLNQ13421 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MSLNQ13421 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MSLNQ13421 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MSLNQ13421 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MSLNQ13421 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MSLNQ13421 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MSLNQ13421 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MSLNQ13421 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MSLNQ13421 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MSLNQ13421 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MSLNQ13421 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MSLNQ13421 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MSLNQ13421 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MSLNQ13421 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MSLNQ13421 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MSLNQ13421 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MSLNQ13421 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MSLNQ13421 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MSLNQ13421 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MSLNQ13421 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MSLNQ13421 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MSLNQ13421 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MSLNQ13421 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MSLNQ13421 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MSLNQ13421 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MSLNQ13421 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MSLNQ13421 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MSLNQ13421 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MSLNQ13421 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MSLNQ13421 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MSLNQ13421 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MSLNQ13421 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
MSLNQ13421 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MSLNQ13421 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MSLNQ13421 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MSLNQ13421 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MSLNQ13421 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MSLNQ13421 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MSLNQ13421 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
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