Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SEMA3FQ13275 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SEMA3FQ13275 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SEMA3FQ13275 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SEMA3FQ13275 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SEMA3FQ13275 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SEMA3FQ13275 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SEMA3FQ13275 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SEMA3FQ13275 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SEMA3FQ13275 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SEMA3FQ13275 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SEMA3FQ13275 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SEMA3FQ13275 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SEMA3FQ13275 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SEMA3FQ13275 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SEMA3FQ13275 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SEMA3FQ13275 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SEMA3FQ13275 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SEMA3FQ13275 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SEMA3FQ13275 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SEMA3FQ13275 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SEMA3FQ13275 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
SEMA3FQ13275 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SEMA3FQ13275 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SEMA3FQ13275 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SEMA3FQ13275 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SEMA3FQ13275 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SEMA3FQ13275 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SEMA3FQ13275 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SEMA3FQ13275 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SEMA3FQ13275 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SEMA3FQ13275 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SEMA3FQ13275 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SEMA3FQ13275 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SEMA3FQ13275 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SEMA3FQ13275 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SEMA3FQ13275 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SEMA3FQ13275 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SEMA3FQ13275 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SEMA3FQ13275 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SEMA3FQ13275 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SEMA3FQ13275 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SEMA3FQ13275 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SEMA3FQ13275 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SEMA3FQ13275 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SEMA3FQ13275 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SEMA3FQ13275 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SEMA3FQ13275 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SEMA3FQ13275 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SEMA3FQ13275 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SEMA3FQ13275 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SEMA3FQ13275 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SEMA3FQ13275 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SEMA3FQ13275 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SEMA3FQ13275 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SEMA3FQ13275 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
SEMA3FQ13275 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SEMA3FQ13275 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SEMA3FQ13275 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
SEMA3FQ13275 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SEMA3FQ13275 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SEMA3FQ13275 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SEMA3FQ13275 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SEMA3FQ13275 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SEMA3FQ13275 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SEMA3FQ13275 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SEMA3FQ13275 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SEMA3FQ13275 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SEMA3FQ13275 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SEMA3FQ13275 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SEMA3FQ13275 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SEMA3FQ13275 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SEMA3FQ13275 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SEMA3FQ13275 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SEMA3FQ13275 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SEMA3FQ13275 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SEMA3FQ13275 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SEMA3FQ13275 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SEMA3FQ13275 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SEMA3FQ13275 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SEMA3FQ13275 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SEMA3FQ13275 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SEMA3FQ13275 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SEMA3FQ13275 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SEMA3FQ13275 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SEMA3FQ13275 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SEMA3FQ13275 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
SEMA3FQ13275 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
SEMA3FQ13275 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SEMA3FQ13275 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SEMA3FQ13275 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SEMA3FQ13275 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SEMA3FQ13275 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SEMA3FQ13275 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SEMA3FQ13275 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SEMA3FQ13275 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SEMA3FQ13275 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SEMA3FQ13275 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SEMA3FQ13275 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SEMA3FQ13275 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms