Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTP4A2Q12974 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTP4A2Q12974 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTP4A2Q12974 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTP4A2Q12974 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTP4A2Q12974 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
PTP4A2Q12974 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
PTP4A2Q12974 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTP4A2Q12974 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTP4A2Q12974 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PTP4A2Q12974 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTP4A2Q12974 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTP4A2Q12974 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTP4A2Q12974 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTP4A2Q12974 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTP4A2Q12974 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTP4A2Q12974 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTP4A2Q12974 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTP4A2Q12974 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PTP4A2Q12974 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTP4A2Q12974 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTP4A2Q12974 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTP4A2Q12974 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTP4A2Q12974 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PTP4A2Q12974 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTP4A2Q12974 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTP4A2Q12974 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTP4A2Q12974 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTP4A2Q12974 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTP4A2Q12974 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTP4A2Q12974 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTP4A2Q12974 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTP4A2Q12974 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTP4A2Q12974 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTP4A2Q12974 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTP4A2Q12974 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTP4A2Q12974 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTP4A2Q12974 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTP4A2Q12974 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTP4A2Q12974 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTP4A2Q12974 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PTP4A2Q12974 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTP4A2Q12974 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTP4A2Q12974 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTP4A2Q12974 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTP4A2Q12974 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTP4A2Q12974 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTP4A2Q12974 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTP4A2Q12974 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTP4A2Q12974 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTP4A2Q12974 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PTP4A2Q12974 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTP4A2Q12974 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTP4A2Q12974 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTP4A2Q12974 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTP4A2Q12974 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTP4A2Q12974 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTP4A2Q12974 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTP4A2Q12974 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTP4A2Q12974 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTP4A2Q12974 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTP4A2Q12974 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTP4A2Q12974 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PTP4A2Q12974 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTP4A2Q12974 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTP4A2Q12974 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTP4A2Q12974 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTP4A2Q12974 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTP4A2Q12974 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTP4A2Q12974 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTP4A2Q12974 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTP4A2Q12974 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTP4A2Q12974 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTP4A2Q12974 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTP4A2Q12974 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTP4A2Q12974 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTP4A2Q12974 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTP4A2Q12974 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTP4A2Q12974 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTP4A2Q12974 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PTP4A2Q12974 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTP4A2Q12974 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTP4A2Q12974 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTP4A2Q12974 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTP4A2Q12974 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTP4A2Q12974 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTP4A2Q12974 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTP4A2Q12974 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTP4A2Q12974 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTP4A2Q12974 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTP4A2Q12974 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTP4A2Q12974 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTP4A2Q12974 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTP4A2Q12974 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTP4A2Q12974 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTP4A2Q12974 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PTP4A2Q12974 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTP4A2Q12974 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTP4A2Q12974 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTP4A2Q12974 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms