Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCN1BQ07699 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCN1BQ07699 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SCN1BQ07699 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCN1BQ07699 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCN1BQ07699 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCN1BQ07699 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCN1BQ07699 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCN1BQ07699 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN1BQ07699 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN1BQ07699 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN1BQ07699 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN1BQ07699 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN1BQ07699 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN1BQ07699 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN1BQ07699 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN1BQ07699 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN1BQ07699 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN1BQ07699 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN1BQ07699 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN1BQ07699 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN1BQ07699 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN1BQ07699 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN1BQ07699 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN1BQ07699 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN1BQ07699 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN1BQ07699 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN1BQ07699 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN1BQ07699 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN1BQ07699 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN1BQ07699 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN1BQ07699 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN1BQ07699 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN1BQ07699 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN1BQ07699 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN1BQ07699 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN1BQ07699 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN1BQ07699 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN1BQ07699 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN1BQ07699 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN1BQ07699 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCN1BQ07699 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCN1BQ07699 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCN1BQ07699 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCN1BQ07699 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCN1BQ07699 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN1BQ07699 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN1BQ07699 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN1BQ07699 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN1BQ07699 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN1BQ07699 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN1BQ07699 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN1BQ07699 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCN1BQ07699 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN1BQ07699 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN1BQ07699 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN1BQ07699 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN1BQ07699 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN1BQ07699 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCN1BQ07699 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN1BQ07699 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN1BQ07699 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN1BQ07699 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN1BQ07699 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCN1BQ07699 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN1BQ07699 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCN1BQ07699 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN1BQ07699 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN1BQ07699 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCN1BQ07699 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN1BQ07699 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN1BQ07699 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN1BQ07699 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCN1BQ07699 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN1BQ07699 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN1BQ07699 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN1BQ07699 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN1BQ07699 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN1BQ07699 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN1BQ07699 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN1BQ07699 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN1BQ07699 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN1BQ07699 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN1BQ07699 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN1BQ07699 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN1BQ07699 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN1BQ07699 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN1BQ07699 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN1BQ07699 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN1BQ07699 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN1BQ07699 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN1BQ07699 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN1BQ07699 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN1BQ07699 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN1BQ07699 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN1BQ07699 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN1BQ07699 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN1BQ07699 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN1BQ07699 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN1BQ07699 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms