Protein–RNA interactions for Protein: Q07326

PIGF, Phosphatidylinositol-glycan biosynthesis class F protein, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIGFQ07326 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIGFQ07326 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIGFQ07326 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIGFQ07326 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIGFQ07326 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIGFQ07326 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIGFQ07326 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIGFQ07326 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIGFQ07326 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIGFQ07326 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIGFQ07326 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIGFQ07326 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIGFQ07326 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIGFQ07326 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIGFQ07326 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIGFQ07326 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIGFQ07326 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIGFQ07326 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIGFQ07326 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIGFQ07326 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIGFQ07326 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIGFQ07326 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIGFQ07326 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIGFQ07326 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIGFQ07326 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIGFQ07326 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PIGFQ07326 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PIGFQ07326 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PIGFQ07326 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIGFQ07326 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIGFQ07326 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIGFQ07326 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIGFQ07326 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIGFQ07326 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIGFQ07326 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIGFQ07326 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIGFQ07326 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIGFQ07326 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIGFQ07326 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIGFQ07326 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIGFQ07326 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIGFQ07326 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIGFQ07326 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIGFQ07326 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIGFQ07326 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PIGFQ07326 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIGFQ07326 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIGFQ07326 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIGFQ07326 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PIGFQ07326 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIGFQ07326 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIGFQ07326 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIGFQ07326 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PIGFQ07326 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIGFQ07326 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIGFQ07326 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIGFQ07326 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIGFQ07326 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIGFQ07326 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIGFQ07326 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIGFQ07326 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIGFQ07326 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIGFQ07326 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIGFQ07326 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PIGFQ07326 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIGFQ07326 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIGFQ07326 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIGFQ07326 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIGFQ07326 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIGFQ07326 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIGFQ07326 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIGFQ07326 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIGFQ07326 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIGFQ07326 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIGFQ07326 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIGFQ07326 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIGFQ07326 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIGFQ07326 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIGFQ07326 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIGFQ07326 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIGFQ07326 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIGFQ07326 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIGFQ07326 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIGFQ07326 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIGFQ07326 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIGFQ07326 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIGFQ07326 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIGFQ07326 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIGFQ07326 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIGFQ07326 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIGFQ07326 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIGFQ07326 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PIGFQ07326 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIGFQ07326 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIGFQ07326 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIGFQ07326 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIGFQ07326 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIGFQ07326 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIGFQ07326 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIGFQ07326 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms