Protein–RNA interactions for Protein: Q04727

TLE4, Transducin-like enhancer protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE4Q04727 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLE4Q04727 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TLE4Q04727 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TLE4Q04727 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLE4Q04727 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLE4Q04727 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TLE4Q04727 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLE4Q04727 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLE4Q04727 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLE4Q04727 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLE4Q04727 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TLE4Q04727 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TLE4Q04727 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TLE4Q04727 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TLE4Q04727 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TLE4Q04727 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TLE4Q04727 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TLE4Q04727 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TLE4Q04727 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TLE4Q04727 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLE4Q04727 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLE4Q04727 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLE4Q04727 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLE4Q04727 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TLE4Q04727 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLE4Q04727 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLE4Q04727 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLE4Q04727 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TLE4Q04727 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TLE4Q04727 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TLE4Q04727 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLE4Q04727 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLE4Q04727 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TLE4Q04727 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TLE4Q04727 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TLE4Q04727 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TLE4Q04727 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TLE4Q04727 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TLE4Q04727 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TLE4Q04727 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TLE4Q04727 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TLE4Q04727 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TLE4Q04727 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TLE4Q04727 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TLE4Q04727 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TLE4Q04727 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TLE4Q04727 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TLE4Q04727 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TLE4Q04727 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TLE4Q04727 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TLE4Q04727 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TLE4Q04727 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TLE4Q04727 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TLE4Q04727 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TLE4Q04727 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TLE4Q04727 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TLE4Q04727 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TLE4Q04727 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TLE4Q04727 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TLE4Q04727 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TLE4Q04727 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TLE4Q04727 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TLE4Q04727 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TLE4Q04727 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TLE4Q04727 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TLE4Q04727 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TLE4Q04727 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TLE4Q04727 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TLE4Q04727 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TLE4Q04727 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TLE4Q04727 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TLE4Q04727 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TLE4Q04727 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TLE4Q04727 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TLE4Q04727 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TLE4Q04727 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TLE4Q04727 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TLE4Q04727 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TLE4Q04727 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TLE4Q04727 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TLE4Q04727 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TLE4Q04727 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TLE4Q04727 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TLE4Q04727 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TLE4Q04727 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TLE4Q04727 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TLE4Q04727 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TLE4Q04727 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TLE4Q04727 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TLE4Q04727 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TLE4Q04727 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TLE4Q04727 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TLE4Q04727 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TLE4Q04727 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TLE4Q04727 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TLE4Q04727 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TLE4Q04727 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TLE4Q04727 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TLE4Q04727 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TLE4Q04727 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms