Protein–RNA interactions for Protein: Q04695

KRT17, Keratin, type I cytoskeletal 17, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT17Q04695 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KRT17Q04695 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KRT17Q04695 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KRT17Q04695 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KRT17Q04695 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KRT17Q04695 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KRT17Q04695 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KRT17Q04695 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KRT17Q04695 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KRT17Q04695 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KRT17Q04695 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KRT17Q04695 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KRT17Q04695 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KRT17Q04695 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
KRT17Q04695 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KRT17Q04695 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KRT17Q04695 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KRT17Q04695 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KRT17Q04695 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KRT17Q04695 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KRT17Q04695 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KRT17Q04695 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KRT17Q04695 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KRT17Q04695 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KRT17Q04695 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KRT17Q04695 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KRT17Q04695 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KRT17Q04695 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KRT17Q04695 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KRT17Q04695 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KRT17Q04695 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KRT17Q04695 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KRT17Q04695 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KRT17Q04695 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KRT17Q04695 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KRT17Q04695 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KRT17Q04695 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KRT17Q04695 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KRT17Q04695 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KRT17Q04695 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KRT17Q04695 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KRT17Q04695 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
KRT17Q04695 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
KRT17Q04695 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
KRT17Q04695 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KRT17Q04695 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KRT17Q04695 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KRT17Q04695 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KRT17Q04695 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KRT17Q04695 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KRT17Q04695 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KRT17Q04695 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KRT17Q04695 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KRT17Q04695 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KRT17Q04695 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KRT17Q04695 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KRT17Q04695 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KRT17Q04695 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KRT17Q04695 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
KRT17Q04695 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
KRT17Q04695 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
KRT17Q04695 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KRT17Q04695 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KRT17Q04695 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KRT17Q04695 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KRT17Q04695 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KRT17Q04695 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KRT17Q04695 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KRT17Q04695 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KRT17Q04695 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KRT17Q04695 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KRT17Q04695 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KRT17Q04695 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KRT17Q04695 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KRT17Q04695 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT17Q04695 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT17Q04695 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KRT17Q04695 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
KRT17Q04695 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KRT17Q04695 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
KRT17Q04695 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KRT17Q04695 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KRT17Q04695 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KRT17Q04695 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KRT17Q04695 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KRT17Q04695 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KRT17Q04695 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KRT17Q04695 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KRT17Q04695 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KRT17Q04695 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KRT17Q04695 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KRT17Q04695 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KRT17Q04695 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KRT17Q04695 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KRT17Q04695 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KRT17Q04695 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KRT17Q04695 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
KRT17Q04695 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KRT17Q04695 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KRT17Q04695 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms