Protein–RNA interactions for Protein: Q04671

OCA2, P protein, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OCA2Q04671 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
OCA2Q04671 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
OCA2Q04671 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
OCA2Q04671 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
OCA2Q04671 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
OCA2Q04671 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
OCA2Q04671 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
OCA2Q04671 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
OCA2Q04671 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
OCA2Q04671 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
OCA2Q04671 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
OCA2Q04671 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
OCA2Q04671 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
OCA2Q04671 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
OCA2Q04671 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
OCA2Q04671 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
OCA2Q04671 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
OCA2Q04671 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
OCA2Q04671 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
OCA2Q04671 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
OCA2Q04671 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
OCA2Q04671 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
OCA2Q04671 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
OCA2Q04671 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
OCA2Q04671 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
OCA2Q04671 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
OCA2Q04671 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OCA2Q04671 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OCA2Q04671 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
OCA2Q04671 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
OCA2Q04671 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
OCA2Q04671 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
OCA2Q04671 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
OCA2Q04671 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
OCA2Q04671 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
OCA2Q04671 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
OCA2Q04671 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OCA2Q04671 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OCA2Q04671 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OCA2Q04671 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OCA2Q04671 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
OCA2Q04671 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
OCA2Q04671 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
OCA2Q04671 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
OCA2Q04671 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
OCA2Q04671 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
OCA2Q04671 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
OCA2Q04671 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
OCA2Q04671 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
OCA2Q04671 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
OCA2Q04671 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
OCA2Q04671 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
OCA2Q04671 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
OCA2Q04671 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
OCA2Q04671 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
OCA2Q04671 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
OCA2Q04671 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
OCA2Q04671 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
OCA2Q04671 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
OCA2Q04671 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OCA2Q04671 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
OCA2Q04671 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
OCA2Q04671 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
OCA2Q04671 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
OCA2Q04671 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
OCA2Q04671 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
OCA2Q04671 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
OCA2Q04671 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
OCA2Q04671 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
OCA2Q04671 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
OCA2Q04671 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
OCA2Q04671 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
OCA2Q04671 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
OCA2Q04671 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
OCA2Q04671 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
OCA2Q04671 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
OCA2Q04671 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
OCA2Q04671 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
OCA2Q04671 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
OCA2Q04671 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
OCA2Q04671 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
OCA2Q04671 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
OCA2Q04671 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
OCA2Q04671 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OCA2Q04671 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OCA2Q04671 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OCA2Q04671 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OCA2Q04671 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OCA2Q04671 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OCA2Q04671 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
OCA2Q04671 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
OCA2Q04671 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
OCA2Q04671 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
OCA2Q04671 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
OCA2Q04671 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
OCA2Q04671 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
OCA2Q04671 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
OCA2Q04671 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
OCA2Q04671 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
OCA2Q04671 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms