Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CAV1Q03135 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAV1Q03135 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAV1Q03135 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CAV1Q03135 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAV1Q03135 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAV1Q03135 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAV1Q03135 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAV1Q03135 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAV1Q03135 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAV1Q03135 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAV1Q03135 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CAV1Q03135 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAV1Q03135 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAV1Q03135 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAV1Q03135 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAV1Q03135 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAV1Q03135 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAV1Q03135 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAV1Q03135 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CAV1Q03135 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CAV1Q03135 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CAV1Q03135 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CAV1Q03135 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CAV1Q03135 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAV1Q03135 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAV1Q03135 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAV1Q03135 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAV1Q03135 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAV1Q03135 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAV1Q03135 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAV1Q03135 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAV1Q03135 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CAV1Q03135 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAV1Q03135 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CAV1Q03135 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAV1Q03135 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAV1Q03135 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAV1Q03135 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAV1Q03135 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAV1Q03135 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAV1Q03135 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAV1Q03135 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAV1Q03135 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAV1Q03135 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAV1Q03135 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAV1Q03135 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAV1Q03135 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAV1Q03135 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAV1Q03135 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAV1Q03135 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAV1Q03135 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAV1Q03135 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAV1Q03135 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAV1Q03135 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAV1Q03135 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAV1Q03135 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAV1Q03135 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAV1Q03135 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAV1Q03135 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAV1Q03135 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CAV1Q03135 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CAV1Q03135 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CAV1Q03135 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CAV1Q03135 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CAV1Q03135 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAV1Q03135 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAV1Q03135 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAV1Q03135 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAV1Q03135 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CAV1Q03135 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAV1Q03135 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAV1Q03135 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CAV1Q03135 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CAV1Q03135 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAV1Q03135 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAV1Q03135 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAV1Q03135 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAV1Q03135 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAV1Q03135 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAV1Q03135 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAV1Q03135 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CAV1Q03135 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAV1Q03135 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAV1Q03135 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAV1Q03135 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAV1Q03135 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAV1Q03135 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAV1Q03135 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CAV1Q03135 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CAV1Q03135 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CAV1Q03135 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CAV1Q03135 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAV1Q03135 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAV1Q03135 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAV1Q03135 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAV1Q03135 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CAV1Q03135 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CAV1Q03135 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAV1Q03135 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms