Protein–RNA interactions for Protein: Q00973

B4GALNT1, Beta-1,4 N-acetylgalactosaminyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4GALNT1Q00973 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
B4GALNT1Q00973 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
B4GALNT1Q00973 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
B4GALNT1Q00973 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
B4GALNT1Q00973 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
B4GALNT1Q00973 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
B4GALNT1Q00973 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
B4GALNT1Q00973 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
B4GALNT1Q00973 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
B4GALNT1Q00973 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
B4GALNT1Q00973 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
B4GALNT1Q00973 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
B4GALNT1Q00973 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
B4GALNT1Q00973 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
B4GALNT1Q00973 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
B4GALNT1Q00973 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
B4GALNT1Q00973 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
B4GALNT1Q00973 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
B4GALNT1Q00973 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
B4GALNT1Q00973 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
B4GALNT1Q00973 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
B4GALNT1Q00973 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
B4GALNT1Q00973 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
B4GALNT1Q00973 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
B4GALNT1Q00973 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
B4GALNT1Q00973 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
B4GALNT1Q00973 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
B4GALNT1Q00973 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
B4GALNT1Q00973 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
B4GALNT1Q00973 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
B4GALNT1Q00973 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
B4GALNT1Q00973 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
B4GALNT1Q00973 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
B4GALNT1Q00973 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
B4GALNT1Q00973 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
B4GALNT1Q00973 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
B4GALNT1Q00973 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
B4GALNT1Q00973 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
B4GALNT1Q00973 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
B4GALNT1Q00973 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
B4GALNT1Q00973 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
B4GALNT1Q00973 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
B4GALNT1Q00973 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
B4GALNT1Q00973 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
B4GALNT1Q00973 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
B4GALNT1Q00973 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
B4GALNT1Q00973 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
B4GALNT1Q00973 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
B4GALNT1Q00973 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
B4GALNT1Q00973 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
B4GALNT1Q00973 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
B4GALNT1Q00973 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
B4GALNT1Q00973 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
B4GALNT1Q00973 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
B4GALNT1Q00973 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
B4GALNT1Q00973 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
B4GALNT1Q00973 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
B4GALNT1Q00973 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
B4GALNT1Q00973 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
B4GALNT1Q00973 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
B4GALNT1Q00973 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
B4GALNT1Q00973 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
B4GALNT1Q00973 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
B4GALNT1Q00973 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
B4GALNT1Q00973 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
B4GALNT1Q00973 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
B4GALNT1Q00973 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
B4GALNT1Q00973 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
B4GALNT1Q00973 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
B4GALNT1Q00973 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
B4GALNT1Q00973 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
B4GALNT1Q00973 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
B4GALNT1Q00973 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
B4GALNT1Q00973 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
B4GALNT1Q00973 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
B4GALNT1Q00973 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
B4GALNT1Q00973 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
B4GALNT1Q00973 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
B4GALNT1Q00973 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
B4GALNT1Q00973 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
B4GALNT1Q00973 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
B4GALNT1Q00973 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
B4GALNT1Q00973 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
B4GALNT1Q00973 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
B4GALNT1Q00973 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
B4GALNT1Q00973 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
B4GALNT1Q00973 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
B4GALNT1Q00973 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
B4GALNT1Q00973 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
B4GALNT1Q00973 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
B4GALNT1Q00973 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
B4GALNT1Q00973 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
B4GALNT1Q00973 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
B4GALNT1Q00973 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
B4GALNT1Q00973 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
B4GALNT1Q00973 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
B4GALNT1Q00973 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
B4GALNT1Q00973 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
B4GALNT1Q00973 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
B4GALNT1Q00973 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms