Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EFNB1P98172 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EFNB1P98172 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EFNB1P98172 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
EFNB1P98172 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFNB1P98172 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFNB1P98172 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFNB1P98172 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFNB1P98172 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFNB1P98172 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFNB1P98172 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFNB1P98172 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFNB1P98172 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFNB1P98172 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFNB1P98172 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFNB1P98172 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFNB1P98172 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFNB1P98172 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFNB1P98172 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFNB1P98172 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFNB1P98172 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFNB1P98172 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFNB1P98172 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EFNB1P98172 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EFNB1P98172 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EFNB1P98172 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFNB1P98172 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFNB1P98172 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFNB1P98172 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFNB1P98172 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFNB1P98172 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFNB1P98172 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EFNB1P98172 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFNB1P98172 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFNB1P98172 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFNB1P98172 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFNB1P98172 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFNB1P98172 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFNB1P98172 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EFNB1P98172 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFNB1P98172 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EFNB1P98172 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EFNB1P98172 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFNB1P98172 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EFNB1P98172 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EFNB1P98172 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EFNB1P98172 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EFNB1P98172 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EFNB1P98172 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EFNB1P98172 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EFNB1P98172 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EFNB1P98172 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EFNB1P98172 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EFNB1P98172 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EFNB1P98172 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EFNB1P98172 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EFNB1P98172 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EFNB1P98172 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EFNB1P98172 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EFNB1P98172 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EFNB1P98172 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EFNB1P98172 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EFNB1P98172 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EFNB1P98172 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EFNB1P98172 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
EFNB1P98172 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EFNB1P98172 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EFNB1P98172 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EFNB1P98172 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EFNB1P98172 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EFNB1P98172 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EFNB1P98172 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EFNB1P98172 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EFNB1P98172 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFNB1P98172 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EFNB1P98172 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EFNB1P98172 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EFNB1P98172 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EFNB1P98172 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EFNB1P98172 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EFNB1P98172 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EFNB1P98172 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EFNB1P98172 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EFNB1P98172 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EFNB1P98172 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EFNB1P98172 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EFNB1P98172 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EFNB1P98172 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EFNB1P98172 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
EFNB1P98172 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EFNB1P98172 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
EFNB1P98172 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
EFNB1P98172 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
EFNB1P98172 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EFNB1P98172 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EFNB1P98172 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EFNB1P98172 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EFNB1P98172 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EFNB1P98172 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EFNB1P98172 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms