Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
VLDLRP98155 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VLDLRP98155 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VLDLRP98155 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VLDLRP98155 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VLDLRP98155 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VLDLRP98155 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VLDLRP98155 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VLDLRP98155 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VLDLRP98155 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VLDLRP98155 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VLDLRP98155 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VLDLRP98155 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VLDLRP98155 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VLDLRP98155 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VLDLRP98155 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
VLDLRP98155 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VLDLRP98155 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VLDLRP98155 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VLDLRP98155 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
VLDLRP98155 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VLDLRP98155 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VLDLRP98155 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VLDLRP98155 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VLDLRP98155 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VLDLRP98155 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VLDLRP98155 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VLDLRP98155 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VLDLRP98155 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VLDLRP98155 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VLDLRP98155 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VLDLRP98155 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VLDLRP98155 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VLDLRP98155 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VLDLRP98155 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VLDLRP98155 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VLDLRP98155 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VLDLRP98155 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VLDLRP98155 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VLDLRP98155 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VLDLRP98155 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VLDLRP98155 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VLDLRP98155 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VLDLRP98155 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VLDLRP98155 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VLDLRP98155 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VLDLRP98155 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VLDLRP98155 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VLDLRP98155 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VLDLRP98155 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VLDLRP98155 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VLDLRP98155 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VLDLRP98155 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VLDLRP98155 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VLDLRP98155 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VLDLRP98155 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VLDLRP98155 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VLDLRP98155 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VLDLRP98155 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VLDLRP98155 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VLDLRP98155 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VLDLRP98155 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VLDLRP98155 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VLDLRP98155 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VLDLRP98155 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VLDLRP98155 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VLDLRP98155 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VLDLRP98155 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VLDLRP98155 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VLDLRP98155 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VLDLRP98155 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VLDLRP98155 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VLDLRP98155 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VLDLRP98155 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VLDLRP98155 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VLDLRP98155 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VLDLRP98155 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VLDLRP98155 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VLDLRP98155 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
VLDLRP98155 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VLDLRP98155 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VLDLRP98155 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VLDLRP98155 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VLDLRP98155 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VLDLRP98155 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VLDLRP98155 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VLDLRP98155 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VLDLRP98155 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VLDLRP98155 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VLDLRP98155 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VLDLRP98155 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VLDLRP98155 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VLDLRP98155 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
VLDLRP98155 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VLDLRP98155 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VLDLRP98155 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VLDLRP98155 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VLDLRP98155 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VLDLRP98155 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VLDLRP98155 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms