Protein–RNA interactions for Protein: P82673

MRPS35, 28S ribosomal protein S35, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS35P82673 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MRPS35P82673 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MRPS35P82673 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MRPS35P82673 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MRPS35P82673 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MRPS35P82673 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MRPS35P82673 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MRPS35P82673 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MRPS35P82673 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MRPS35P82673 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MRPS35P82673 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MRPS35P82673 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MRPS35P82673 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MRPS35P82673 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MRPS35P82673 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MRPS35P82673 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MRPS35P82673 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MRPS35P82673 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MRPS35P82673 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MRPS35P82673 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MRPS35P82673 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MRPS35P82673 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MRPS35P82673 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MRPS35P82673 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MRPS35P82673 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MRPS35P82673 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MRPS35P82673 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MRPS35P82673 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MRPS35P82673 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MRPS35P82673 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MRPS35P82673 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MRPS35P82673 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MRPS35P82673 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MRPS35P82673 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MRPS35P82673 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MRPS35P82673 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MRPS35P82673 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MRPS35P82673 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MRPS35P82673 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MRPS35P82673 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MRPS35P82673 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MRPS35P82673 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MRPS35P82673 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MRPS35P82673 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MRPS35P82673 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MRPS35P82673 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MRPS35P82673 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MRPS35P82673 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MRPS35P82673 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MRPS35P82673 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MRPS35P82673 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MRPS35P82673 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MRPS35P82673 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MRPS35P82673 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MRPS35P82673 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MRPS35P82673 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MRPS35P82673 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MRPS35P82673 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MRPS35P82673 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MRPS35P82673 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MRPS35P82673 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MRPS35P82673 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MRPS35P82673 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MRPS35P82673 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MRPS35P82673 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MRPS35P82673 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRPS35P82673 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRPS35P82673 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRPS35P82673 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRPS35P82673 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRPS35P82673 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRPS35P82673 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MRPS35P82673 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MRPS35P82673 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MRPS35P82673 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MRPS35P82673 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MRPS35P82673 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRPS35P82673 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRPS35P82673 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MRPS35P82673 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MRPS35P82673 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MRPS35P82673 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MRPS35P82673 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MRPS35P82673 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MRPS35P82673 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MRPS35P82673 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MRPS35P82673 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MRPS35P82673 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MRPS35P82673 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MRPS35P82673 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MRPS35P82673 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MRPS35P82673 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MRPS35P82673 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MRPS35P82673 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MRPS35P82673 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MRPS35P82673 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MRPS35P82673 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MRPS35P82673 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MRPS35P82673 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MRPS35P82673 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 242.5 ms