Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB15P59190 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB15P59190 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB15P59190 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB15P59190 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB15P59190 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB15P59190 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB15P59190 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB15P59190 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
RAB15P59190 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB15P59190 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB15P59190 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB15P59190 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB15P59190 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB15P59190 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB15P59190 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB15P59190 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB15P59190 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB15P59190 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB15P59190 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB15P59190 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB15P59190 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB15P59190 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB15P59190 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB15P59190 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB15P59190 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB15P59190 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB15P59190 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB15P59190 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB15P59190 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB15P59190 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB15P59190 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB15P59190 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB15P59190 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB15P59190 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB15P59190 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB15P59190 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB15P59190 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB15P59190 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB15P59190 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB15P59190 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB15P59190 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB15P59190 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB15P59190 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB15P59190 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB15P59190 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB15P59190 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB15P59190 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB15P59190 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB15P59190 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB15P59190 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB15P59190 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB15P59190 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB15P59190 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB15P59190 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB15P59190 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAB15P59190 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAB15P59190 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RAB15P59190 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB15P59190 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB15P59190 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB15P59190 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB15P59190 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB15P59190 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB15P59190 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB15P59190 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB15P59190 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB15P59190 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB15P59190 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB15P59190 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB15P59190 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB15P59190 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB15P59190 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB15P59190 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB15P59190 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB15P59190 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB15P59190 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB15P59190 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB15P59190 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB15P59190 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB15P59190 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB15P59190 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB15P59190 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB15P59190 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB15P59190 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB15P59190 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB15P59190 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB15P59190 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB15P59190 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB15P59190 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB15P59190 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB15P59190 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB15P59190 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB15P59190 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB15P59190 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB15P59190 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB15P59190 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB15P59190 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB15P59190 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB15P59190 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms