Protein–RNA interactions for Protein: P57088

TMEM33, Transmembrane protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM33P57088 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM33P57088 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM33P57088 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM33P57088 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM33P57088 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM33P57088 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM33P57088 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM33P57088 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM33P57088 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM33P57088 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM33P57088 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TMEM33P57088 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM33P57088 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM33P57088 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM33P57088 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM33P57088 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM33P57088 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM33P57088 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM33P57088 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM33P57088 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM33P57088 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM33P57088 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM33P57088 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM33P57088 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM33P57088 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM33P57088 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM33P57088 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM33P57088 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM33P57088 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM33P57088 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM33P57088 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM33P57088 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM33P57088 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM33P57088 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM33P57088 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM33P57088 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM33P57088 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM33P57088 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM33P57088 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM33P57088 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM33P57088 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM33P57088 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM33P57088 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM33P57088 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM33P57088 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM33P57088 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM33P57088 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM33P57088 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM33P57088 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM33P57088 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM33P57088 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM33P57088 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM33P57088 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM33P57088 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM33P57088 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM33P57088 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM33P57088 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM33P57088 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM33P57088 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM33P57088 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM33P57088 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM33P57088 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM33P57088 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM33P57088 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM33P57088 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM33P57088 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM33P57088 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM33P57088 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM33P57088 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM33P57088 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM33P57088 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM33P57088 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM33P57088 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM33P57088 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM33P57088 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM33P57088 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM33P57088 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM33P57088 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM33P57088 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM33P57088 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM33P57088 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM33P57088 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM33P57088 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM33P57088 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM33P57088 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM33P57088 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM33P57088 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM33P57088 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM33P57088 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM33P57088 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM33P57088 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM33P57088 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM33P57088 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM33P57088 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM33P57088 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM33P57088 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM33P57088 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM33P57088 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM33P57088 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM33P57088 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms