Protein–RNA interactions for Protein: P55291

CDH15, Cadherin-15, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH15P55291 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH15P55291 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH15P55291 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH15P55291 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDH15P55291 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDH15P55291 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH15P55291 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH15P55291 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH15P55291 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH15P55291 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH15P55291 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH15P55291 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH15P55291 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH15P55291 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH15P55291 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH15P55291 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH15P55291 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH15P55291 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH15P55291 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH15P55291 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH15P55291 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH15P55291 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH15P55291 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH15P55291 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDH15P55291 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDH15P55291 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDH15P55291 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDH15P55291 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH15P55291 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH15P55291 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH15P55291 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH15P55291 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH15P55291 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH15P55291 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH15P55291 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH15P55291 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH15P55291 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH15P55291 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH15P55291 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH15P55291 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH15P55291 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH15P55291 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH15P55291 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH15P55291 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH15P55291 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH15P55291 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH15P55291 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH15P55291 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH15P55291 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH15P55291 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH15P55291 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH15P55291 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH15P55291 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH15P55291 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH15P55291 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH15P55291 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH15P55291 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH15P55291 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH15P55291 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDH15P55291 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH15P55291 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDH15P55291 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH15P55291 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH15P55291 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH15P55291 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH15P55291 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH15P55291 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDH15P55291 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH15P55291 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH15P55291 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH15P55291 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH15P55291 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH15P55291 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDH15P55291 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH15P55291 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDH15P55291 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH15P55291 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH15P55291 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDH15P55291 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH15P55291 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH15P55291 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH15P55291 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH15P55291 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH15P55291 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH15P55291 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH15P55291 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH15P55291 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH15P55291 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH15P55291 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH15P55291 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH15P55291 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH15P55291 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH15P55291 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH15P55291 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH15P55291 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH15P55291 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH15P55291 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH15P55291 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH15P55291 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH15P55291 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms