Protein–RNA interactions for Protein: P55209

NAP1L1, Nucleosome assembly protein 1-like 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L1P55209 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NAP1L1P55209 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NAP1L1P55209 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NAP1L1P55209 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NAP1L1P55209 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NAP1L1P55209 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NAP1L1P55209 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NAP1L1P55209 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NAP1L1P55209 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NAP1L1P55209 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NAP1L1P55209 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NAP1L1P55209 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NAP1L1P55209 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NAP1L1P55209 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NAP1L1P55209 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NAP1L1P55209 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NAP1L1P55209 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NAP1L1P55209 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NAP1L1P55209 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NAP1L1P55209 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NAP1L1P55209 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NAP1L1P55209 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NAP1L1P55209 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NAP1L1P55209 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NAP1L1P55209 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NAP1L1P55209 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NAP1L1P55209 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NAP1L1P55209 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NAP1L1P55209 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NAP1L1P55209 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NAP1L1P55209 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NAP1L1P55209 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NAP1L1P55209 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NAP1L1P55209 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NAP1L1P55209 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NAP1L1P55209 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NAP1L1P55209 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NAP1L1P55209 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NAP1L1P55209 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NAP1L1P55209 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NAP1L1P55209 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NAP1L1P55209 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NAP1L1P55209 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NAP1L1P55209 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NAP1L1P55209 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NAP1L1P55209 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NAP1L1P55209 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NAP1L1P55209 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NAP1L1P55209 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NAP1L1P55209 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NAP1L1P55209 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NAP1L1P55209 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NAP1L1P55209 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NAP1L1P55209 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NAP1L1P55209 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NAP1L1P55209 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NAP1L1P55209 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NAP1L1P55209 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NAP1L1P55209 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NAP1L1P55209 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NAP1L1P55209 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NAP1L1P55209 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NAP1L1P55209 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NAP1L1P55209 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NAP1L1P55209 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NAP1L1P55209 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NAP1L1P55209 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NAP1L1P55209 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NAP1L1P55209 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NAP1L1P55209 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NAP1L1P55209 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NAP1L1P55209 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NAP1L1P55209 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NAP1L1P55209 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NAP1L1P55209 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NAP1L1P55209 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NAP1L1P55209 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NAP1L1P55209 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NAP1L1P55209 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NAP1L1P55209 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NAP1L1P55209 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NAP1L1P55209 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NAP1L1P55209 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NAP1L1P55209 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NAP1L1P55209 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NAP1L1P55209 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NAP1L1P55209 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NAP1L1P55209 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NAP1L1P55209 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NAP1L1P55209 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NAP1L1P55209 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NAP1L1P55209 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NAP1L1P55209 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NAP1L1P55209 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NAP1L1P55209 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NAP1L1P55209 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
NAP1L1P55209 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NAP1L1P55209 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NAP1L1P55209 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NAP1L1P55209 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms