Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
EPHB4P54760 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
EPHB4P54760 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
EPHB4P54760 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
EPHB4P54760 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
EPHB4P54760 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
EPHB4P54760 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
EPHB4P54760 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
EPHB4P54760 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
EPHB4P54760 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
EPHB4P54760 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
EPHB4P54760 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
EPHB4P54760 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
EPHB4P54760 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
EPHB4P54760 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
EPHB4P54760 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
EPHB4P54760 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
EPHB4P54760 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
EPHB4P54760 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
EPHB4P54760 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
EPHB4P54760 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
EPHB4P54760 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
EPHB4P54760 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.94■■■□□ 2.38
EPHB4P54760 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
EPHB4P54760 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
EPHB4P54760 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
EPHB4P54760 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
EPHB4P54760 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
EPHB4P54760 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
EPHB4P54760 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
EPHB4P54760 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
EPHB4P54760 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
EPHB4P54760 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
EPHB4P54760 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
EPHB4P54760 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
EPHB4P54760 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
EPHB4P54760 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
EPHB4P54760 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
EPHB4P54760 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
EPHB4P54760 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
EPHB4P54760 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
EPHB4P54760 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
EPHB4P54760 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
EPHB4P54760 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
EPHB4P54760 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
EPHB4P54760 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
EPHB4P54760 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
EPHB4P54760 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
EPHB4P54760 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
EPHB4P54760 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
EPHB4P54760 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
EPHB4P54760 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
EPHB4P54760 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
EPHB4P54760 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
EPHB4P54760 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
EPHB4P54760 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
EPHB4P54760 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
EPHB4P54760 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
EPHB4P54760 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
EPHB4P54760 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
EPHB4P54760 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
EPHB4P54760 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
EPHB4P54760 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
EPHB4P54760 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
EPHB4P54760 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
EPHB4P54760 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
EPHB4P54760 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
EPHB4P54760 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
EPHB4P54760 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
EPHB4P54760 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
EPHB4P54760 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
EPHB4P54760 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
EPHB4P54760 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
EPHB4P54760 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
EPHB4P54760 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
EPHB4P54760 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
EPHB4P54760 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
EPHB4P54760 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
EPHB4P54760 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
EPHB4P54760 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
EPHB4P54760 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
EPHB4P54760 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
EPHB4P54760 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
EPHB4P54760 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
EPHB4P54760 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
EPHB4P54760 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
EPHB4P54760 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
EPHB4P54760 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
EPHB4P54760 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
EPHB4P54760 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
EPHB4P54760 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
EPHB4P54760 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
EPHB4P54760 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
EPHB4P54760 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
EPHB4P54760 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
EPHB4P54760 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
EPHB4P54760 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
EPHB4P54760 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
EPHB4P54760 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
EPHB4P54760 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms